RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596332.1

LIG1-210, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIG1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-210ENST00000596332 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 GAGE12JA6NER3 117 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 RAB4AP20338 218 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 AKR1D1P51857 326 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 UBE2D3P61077 147 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 UBE2D2P62837 147 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 GAGE1Q13065 139 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 GAGE4Q13068 117 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 GAGE5Q13069 117 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 GAGE13Q4V321 117 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.24□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 A0A087WWC5 75 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.23□□□□□ -1.25
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LIG1-210ENST00000596332 TRGC1P0CF51 173 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 TIRAPP58753 221 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 NEGR1Q7Z3B1 354 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.23□□□□□ -1.25
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LIG1-210ENST00000596332 CTDSP1Q9GZU7 261 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 TMEM242Q9NWH2 141 aa7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 DNAH2Q9P225 4427 aa7.23□□□□□ -1.25
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LIG1-210ENST00000596332 ZNF56Q15929 161 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 Q6ZR54 194 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 AMN1Q8IY45 258 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 YPEL4Q96NS1 127 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 IMMP2LQ96T52 175 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 C12orf57Q99622 126 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.22□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 F5H697 171 aa7.21□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 MGPP08493 103 aa7.21□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 C5orf52A6NGY3 159 aa7.2□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 SMIM17P0DL12 118 aa7.2□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 RAB5AP20339 215 aa7.2□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 NIT2Q9NQR4 276 aa7.2□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.19□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 A0A1B0GW15 77 aa7.19□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 SMKR1H3BMG3 65 aa7.19□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 Q8N3U1 123 aa7.19□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.17□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 NCR2O95944 276 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 ELOBQ15370 118 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 LELP1Q5T871 98 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 BORCS7Q96B45 105 aa7.17□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 BTF3L4Q96K17 158 aa7.17□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.16□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 MRAP2Q96G30 205 aa7.16□□□□□ -1.26
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LIG1-210ENST00000596332 H7C1H1 209 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 M0R2N4 97 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 SIVA1O15304 175 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 S100PP25815 95 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.15□□□□□ -1.26
LIG1-210ENST00000596332 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.15□□□□□ -1.26
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