RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584446.5

GREB1L-211, Transcript of GREB1 like retinoic acid receptor coactivator, human

TSL 1 (best)

Gene GREB1L, Length 3,020 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GREB1L-211	ENST00000584446	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446		A0A0J9YX75	114 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446		B4DSR2	109 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	BRI3	O95415	125 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	PSMB8	P28062	276 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	TIMM17A	Q99595	171 aa		11.28	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	TRBV27	A0A0K0K1C4	114 aa		11.27	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	CFHR3	Q02985	330 aa		11.27	□□□□□ -0.6
GREB1L-211	ENST00000584446	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		H7C2G1	150 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		J3QQQ9	107 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		M0QY20	66 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	UBE2D1	P51668	147 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	PTH2	Q96A98	100 aa		11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	LGALS9	O00182	355 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.26	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	C9orf85	Q96MD7	179 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	PRM2	P04554	102 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	RAX2	Q96IS3	184 aa		11.25	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		P0DMU3	169 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		K7EQG2	157 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	CFC1B	P0CG36	223 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	CFC1	P0CG37	223 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		11.24	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		A0A0J9YXV3	536 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	IGHV3-30	P01768	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	VCX2	Q9H322	139 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	TRBV6-5	A0A0K0K1A5	114 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	ZNF580	Q9UK33	172 aa		11.23	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	PROK1	P58294	105 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	TCL1B	O95988	128 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	FOXI1	Q12951	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	DEFB136	Q30KP8	78 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	SPX	Q9BT56	116 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		I3L3M4	83 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.22	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446		A4D1N5	150 aa		11.21	□□□□□ -0.61
GREB1L-211	ENST00000584446	NFE4	Q86UQ8	179 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		11.21	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	PRRC2A	P48634	2157 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	UBE2D3	P61077	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	UBE2D2	P62837	147 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		11.2	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	RHOH	Q15669	191 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446		Q1RN00	199 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	AMELX	Q99217	191 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	CD28	P10747	220 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	DEFB131A	P59861	70 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	TMEM223	A0PJW6	202 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	RHOD	O00212	210 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	PRSS2	P07478	247 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	DUX3	Q96PT4	197 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	RBMY1C	P0DJD4	496 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446		Q9UF83	564 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	CHD6	Q8TD26	2715 aa		11.18	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	SLURP1	P55000	103 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	LEPROT	O15243	131 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	JMJD1C	Q15652	2540 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	FBN2	P35556	2912 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446		A8MWV9	139 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GREB1L-211	ENST00000584446	GATA3	P23771	443 aa		11.15	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms