RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584328.1

NF1-223, Transcript of neurofibromin 1, human

TSL 2

Gene NF1, Length 566 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NF1-223	ENST00000584328	LTA	P01374	205 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	IGKV1-17	P01599	117 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	MUC21	Q5SSG8	566 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	FA2H	Q7L5A8	372 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	OTOR	Q9NRC9	128 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		3.78	□□□□□ -1.8
NF1-223	ENST00000584328	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TNC	P24821	2201 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TMEM213	A2RRL7	107 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TMEM189	A5PLL7	270 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	OR2T8	A6NH00	312 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TMEM238	C9JI98	176 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		K7EP34	96 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	NDUFA4	O00483	81 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGLV1-51	P01701	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-23	P01764	117 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	CSN3	P07498	182 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	FABP2	P12104	132 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	S100A7	P31151	101 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	GDF5OS	Q5U4N7	250 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	FXYD5	Q96DB9	178 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SMPX	Q9UHP9	88 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	RABAC1	Q9UI14	185 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		S4R3C0	116 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.77	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		K7EMT4	169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	OVOL1	O14753	267 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	CDK2AP2	O75956	126 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TCRA	P04437	139 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	INSL3	P51460	131 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SYNJ2BP	P57105	145 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TAL2	Q16559	108 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	ERAS	Q7Z444	233 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	OR1B1	Q8NGR6	318 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.76	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		A0A1B0GV72	72 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		A0A1W2PPM0	123 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		F8W1H4	67 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-48	P01763	117 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	BMI1	P35226	326 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	PATE2	Q6UY27	113 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SIGMAR1	Q99720	223 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SLC25A39	Q9BZJ4	359 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	VCX2	Q9H322	139 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		Q9H3A6	140 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HIGD1A	Q9Y241	93 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		U3KQK5	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		A0A087X0K7	114 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SOCS3	O14543	225 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	GNG7	O60262	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	ATP5L	O75964	103 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HBD	P02042	147 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	PYY	P10082	97 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	FGF6	P10767	208 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	PDE6H	Q13956	83 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		Q6ZVH6	145 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		Q86TA4	180 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	LINC01546	A6NGU7	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328		H3BUT2	72 aa		3.73	□□□□□ -1.81
NF1-223	ENST00000584328	SAP30	O75446	220 aa		3.73	□□□□□ -1.81

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