RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578334.5

TSPOAP1-AS1-202, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 956 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHCHD5Q9BSY4 110 aa18.44■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL2L11O43521 198 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C14orf177Q52M58 125 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMUB2Q71RG4 321 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CHAC1Q9BUX1 264 aa18.43■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A0D9SG52 128 aa18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMSDA8MTL9 139 aa18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa18.42■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM17P0DL12 118 aa18.41■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PKIAP61925 76 aa18.4■□□□□ 0.54
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPL35P42766 123 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AP1S3Q96PC3 154 aa18.39■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HLA-DQA1P01909 254 aa18.38■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM97Q5BJF2 176 aa18.38■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa18.38■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa18.37■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DERL1Q9BUN8 251 aa18.37■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNG13Q9P2W3 67 aa18.37■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa18.37■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TPPP3Q9BW30 176 aa18.36■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 VAX2Q9UIW0 290 aa18.36■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 USP17L23D6RBM5 183 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MIAQ16674 131 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MANBALQ9NQG1 85 aa18.35■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CCL20P78556 96 aa18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLPSL2Q6UWE3 100 aa18.34■□□□□ 0.53
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MGPP08493 103 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GZMBP10144 247 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GAGE6Q13070 117 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CENPWQ5EE01 88 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C11orf52Q96A22 123 aa18.33■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RBX1P62877 108 aa18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LINC00269Q8N2A0 174 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OR2D3Q8NGH3 330 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRR34Q9NV39 138 aa18.3■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV2-8P01709 118 aa18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPS20P60866 119 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PRSS1P07477 247 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLC6P0CF74 106 aa18.28■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 H7C1H1 209 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 M0QY20 66 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IQCJQ1A5X6 159 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SUMO4Q6EEV6 95 aa18.27■□□□□ 0.52
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CACNG7P62955 275 aa18.26■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 FAT3Q8TDW7 4589 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAB19A4D1S5 217 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C19orf71A6NCJ1 209 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TEX46H3BTG2 121 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 GNG4P50150 75 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RAB5CP51148 216 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa18.25■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa18.24■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 XKRY2A2RUG3 117 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SMIM12Q96EX1 92 aa18.23■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 P01737 135 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 REG3AQ06141 175 aa18.22■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RASL11AQ6T310 242 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C9orf163Q8N9P6 203 aa18.21■□□□□ 0.51
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 F2Z2F3 143 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PDE6DO43924 150 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRGC1P0CF51 173 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TMEM243Q9BU79 118 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 MED9Q9NWA0 146 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa18.2■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IFNA1P01562 189 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SULT1A2P50226 295 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 LYZL1Q6UWQ5 148 aa18.19■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 C20orf203Q8NBC4 194 aa18.18■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 DPH3P1Q9H4G8 78 aa18.18■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 CLRN3Q8NCR9 226 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BIN3Q9NQY0 253 aa18.17■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 OXTP01178 125 aa18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NTF3P20783 257 aa18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 NIT2Q9NQR4 276 aa18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa18.15■□□□□ 0.5
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 A0A1B0GUV1 79 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 BCL2P10415 239 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 PGLYRP4Q96LB8 373 aa18.14■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 HMCN2Q8NDA2 5059 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 hDV102S1A0JD36 115 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 UBE2L6O14933 153 aa18.13■□□□□ 0.49
TSPOAP1-AS1-202ENST00000578334 SDIM1Q6ZPB5 146 aa18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.3 ms