RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 RASL11AQ6T310 242 aa22.7■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJC30Q96LL9 226 aa22.69■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SIVA1O15304 175 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CTDSP1Q9GZU7 261 aa22.68■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 LELP1Q5T871 98 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 GATD1Q8NB37 220 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa22.67■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FRZBQ92765 325 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIT2Q9NQR4 276 aa22.66■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WWC5 75 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R2N4 97 aa22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 S100A8P05109 93 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAMPP49913 170 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 HBBP68871 147 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10J3Q5JRS4 329 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 WFDC10BQ8IUB3 73 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH6Q9C0G6 4158 aa22.64■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1B0GXF2 115 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q6ZR54 194 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMN1Q8IY45 258 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 IMMP2LQ96T52 175 aa22.63■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF185Q96GF1 192 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAB4AP20338 218 aa22.62■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHEBQ15382 184 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NDUFA5Q16718 116 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLRN3Q8NCR9 226 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM242Q9NWH2 141 aa22.61■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf77A4D0Y5 90 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC32Q5I0X7 151 aa22.6■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOC3P02656 99 aa22.59■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRAP2Q96G30 205 aa22.58■■□□□ 1.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAH10OSP0CZ25 163 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM104BQ5XKR9 115 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNIP4Q6PIL6 250 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTF3L4Q96K17 158 aa22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM97Q5BJF2 176 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SVBPQ8N300 66 aa22.56■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS10P5Q9NQ39 176 aa22.55■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa22.54■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EP13 123 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa22.53■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAS8-AS1O95177 125 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNAPINO95295 136 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 LINC01556Q5JQF7 62 aa22.52■■□□□ 1.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa22.51■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa22.51■■□□□ 1.19
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R17O96001 155 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS10P46783 165 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDHAF1A6NFY7 115 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMKR1H3BMG3 65 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCR2O95944 276 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf134Q5TEV5 83 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 C10orf126Q8N4M7 172 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 ST20Q9HBF5 79 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 NIT1Q86X76 327 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDNEP1-209ENST00000574205 BTF3P20290 206 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IQCJQ1A5X6 159 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 CKS2P33552 79 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 COTL1Q14019 142 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 C6orf223Q8N319 242 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRACQ8N912 160 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-30P01768 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-33P01772 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPBPP02775 128 aa22.42■■□□□ 1.18
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CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD5Q9BSY4 110 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 CHCHD7Q9BUK0 85 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 D6R8Y8 96 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 I3L3M4 83 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q8N3U1 123 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A087WX48 190 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PKIAP61925 76 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTL8CO15255 209 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 PMCHP20382 165 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 ORMDL3Q8N138 153 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa22.37■■□□□ 1.17
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