RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 GNG13Q9P2W3 67 aa16.66■□□□□ 0.26
SPNS1-209ENST00000567771 C15orf54Q8N8G6 183 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-209ENST00000567771 C11orf52Q96A22 123 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-209ENST00000567771 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa16.65■□□□□ 0.26
SPNS1-209ENST00000567771 LINC00528Q8N1L1 170 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 MANBALQ9NQG1 85 aa16.64■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 C1orf43Q9BWL3 253 aa16.63■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 CRPP02741 224 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
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SPNS1-209ENST00000567771 CHCHD5Q9BSY4 110 aa16.62■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 IGLV2-8P01709 118 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 SMIM17P0DL12 118 aa16.61■□□□□ 0.25
SPNS1-209ENST00000567771 GZMBP10144 247 aa16.61■□□□□ 0.25
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SPNS1-209ENST00000567771 AP1S3Q96PC3 154 aa16.61■□□□□ 0.25
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SPNS1-209ENST00000567771 RAB5CP51148 216 aa16.58■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM97Q5BJF2 176 aa16.58■□□□□ 0.24
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SPNS1-209ENST00000567771 C19orf71A6NCJ1 209 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 PKIAP61925 76 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 C14orf177Q52M58 125 aa16.57■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.57■□□□□ 0.24
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SPNS1-209ENST00000567771 SULT1A2P50226 295 aa16.55■□□□□ 0.24
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SPNS1-209ENST00000567771 USP17L23D6RBM5 183 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 TEX46H3BTG2 121 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 M0QY20 66 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 HLA-DQA1P01909 254 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 GNG4P50150 75 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 PRR34Q9NV39 138 aa16.54■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 J3QL48 77 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 SUMO4Q6EEV6 95 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 CLPSL2Q6UWE3 100 aa16.53■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 CACNG7P62955 275 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 IQCJQ1A5X6 159 aa16.52■□□□□ 0.24
SPNS1-209ENST00000567771 LINC00269Q8N2A0 174 aa16.52■□□□□ 0.24
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SPNS1-209ENST00000567771 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa16.51■□□□□ 0.23
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SPNS1-209ENST00000567771 H7C1H1 209 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 P01737 135 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa16.5■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 PRSS1P07477 247 aa16.49■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 LYZL1Q6UWQ5 148 aa16.49■□□□□ 0.23
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SPNS1-209ENST00000567771 F2Z2F3 143 aa16.48■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 IFNA1P01562 189 aa16.48■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SPNS1-209ENST00000567771 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
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SPNS1-209ENST00000567771 TRGC1P0CF51 173 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 NUDT10Q8NFP7 164 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 NUDT11Q96G61 164 aa16.45■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 DPH3P1Q9H4G8 78 aa16.45■□□□□ 0.22
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SPNS1-209ENST00000567771 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 SLC51BQ86UW2 128 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 C9orf62Q8N4C0 152 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 C20orf203Q8NBC4 194 aa16.44■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 NIT2Q9NQR4 276 aa16.43■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 C9orf163Q8N9P6 203 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 TMEM243Q9BU79 118 aa16.42■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 CTRLP40313 264 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.41■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 A0A1B0GUV1 79 aa16.4■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 WDR73Q6P4I2 378 aa16.4■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.4■□□□□ 0.22
SPNS1-209ENST00000567771 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SPNS1-209ENST00000567771 K7EN84 100 aa16.38■□□□□ 0.21
SPNS1-209ENST00000567771 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
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