RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 LRCOL1A6NCL2 159 aa11.43□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-211ENST00000567434 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 NUDT11Q96G61 164 aa11.43□□□□□ -0.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
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CCNDBP1-211ENST00000567434 MPV17L2Q567V2 206 aa11.33□□□□□ -0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 TEX261Q6UWH6 196 aa11.31□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.31□□□□□ -0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 BORCS7Q96B45 105 aa11.3□□□□□ -0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 XGP55808 180 aa11.29□□□□□ -0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 ENHOQ6UWT2 76 aa11.29□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 TSKUQ8WUA8 353 aa11.29□□□□□ -0.6
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RBX1P62877 108 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 GATD1Q8NB37 220 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 BAALCQ8WXS3 180 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM243Q9BU79 118 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 SMDT1Q9H4I9 107 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRR34Q9NV39 138 aa11.28□□□□□ -0.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 GAGE6Q13070 117 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 COTL1Q14019 142 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf177Q52M58 125 aa11.27□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GUT8 65 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A1B0GUV1 79 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 HIGD1CA8MV81 97 aa11.26□□□□□ -0.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.26□□□□□ -0.61
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