RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 Q9HAA7 133 aa13.35□□□□□ -0.27
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CMTM3-211ENST00000565922 FAM231DQ6ZW35 169 aa13.34□□□□□ -0.27
CMTM3-211ENST00000565922 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CMTM3-211ENST00000565922 NIT1Q86X76 327 aa13.34□□□□□ -0.27
CMTM3-211ENST00000565922 SMIM7Q9BQ49 75 aa13.34□□□□□ -0.27
CMTM3-211ENST00000565922 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
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CMTM3-211ENST00000565922 CDK2AP2O75956 126 aa13.32□□□□□ -0.28
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CMTM3-211ENST00000565922 Q8N3U1 123 aa13.3□□□□□ -0.28
CMTM3-211ENST00000565922 SRP19P09132 144 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
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CMTM3-211ENST00000565922 HERC2O95714 4834 aa13.29□□□□□ -0.28
CMTM3-211ENST00000565922 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-211ENST00000565922 RASL11AQ6T310 242 aa13.28□□□□□ -0.28
CMTM3-211ENST00000565922 LINC01551Q86U37 167 aa13.28□□□□□ -0.28
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CMTM3-211ENST00000565922 TMEM262E9PQX1 116 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 GTSF1Q8WW33 167 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 KLK12Q9UKR0 248 aa13.27□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 Q0VG73 95 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 FRZBQ92765 325 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 SMDT1Q9H4I9 107 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 NIT2Q9NQR4 276 aa13.26□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 LRCOL1A6NCL2 159 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 PEA15Q15121 130 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 OSTCQ9NRP0 149 aa13.25□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 LRP1BQ9NZR2 4599 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 FAM231BA6NCW3 169 aa13.24□□□□□ -0.29
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CMTM3-211ENST00000565922 UBE2WQ96B02 151 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 GFRA4Q9GZZ7 299 aa13.24□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.23□□□□□ -0.29
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CMTM3-211ENST00000565922 Q8N814 137 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 TSKUQ8WUA8 353 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.23□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 IQCJQ1A5X6 159 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 MPV17L2Q567V2 206 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.22□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa13.21□□□□□ -0.29
CMTM3-211ENST00000565922 DNAH5Q8TE73 4624 aa13.21□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1B0GUT8 65 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 HIGD1CA8MV81 97 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 NAT8Q9UHE5 227 aa13.2□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 GCSHP23434 173 aa13.19□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 ISOC2Q96AB3 205 aa13.19□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.19□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 COTL1Q14019 142 aa13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 ADIRFQ15847 76 aa13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 GATD1Q8NB37 220 aa13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM243Q9BU79 118 aa13.18□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 GAGE6Q13070 117 aa13.17□□□□□ -0.3
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CMTM3-211ENST00000565922 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa13.17□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 V9GYV3 84 aa13.17□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 RBX1P62877 108 aa13.16□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 Q8N976 141 aa13.16□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 RYR1P21817 5038 aa13.16□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 C9JQL5 133 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 UBE2L6O14933 153 aa13.15□□□□□ -0.3
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CMTM3-211ENST00000565922 RIGQ13278 110 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 ENHOQ6UWT2 76 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM191AQ9H0A3 160 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.15□□□□□ -0.3
CMTM3-211ENST00000565922 AMTP48728 403 aa13.14□□□□□ -0.31
CMTM3-211ENST00000565922 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
CMTM3-211ENST00000565922 BAALCQ8WXS3 180 aa13.14□□□□□ -0.31
CMTM3-211ENST00000565922 A0A1B0GUV1 79 aa13.13□□□□□ -0.31
CMTM3-211ENST00000565922 LECT2O14960 151 aa13.13□□□□□ -0.31
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