RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561304.5

ZEB1-223, Transcript of zinc finger E-box binding homeobox 1, human

TSL 1 (best)

Gene ZEB1, Length 1,383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZEB1-223	ENST00000561304	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	RHOD	O00212	210 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	PSCA	O43653	123 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	GCSH	P23434	173 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	LAGE3	Q14657	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304		Q8N814	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	LECT2	O14960	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SNAI2	O43623	268 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		Q5VSD8	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	PRR27	Q6MZM9	219 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	BAGE2	Q86Y30	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	ZFP82	Q8N141	532 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	PFDN1	O60925	122 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV2-8	P01709	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SLPI	P03973	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2D3	P61077	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2D2	P62837	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	NIT1	Q86X76	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	CXCL1	P09341	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	GZMB	P10144	247 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SST	P61278	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	ZNF56	Q15929	161 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A087WWC5	75 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB4B	P61018	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TMEM70	Q9BUB7	260 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	C19orf71	A6NCJ1	209 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SULT1A2	P50226	295 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	C1QB	P02746	253 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZSA8	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	FRZB	Q92765	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		A0A087WX48	190 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		B5MCH6	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		F5H697	171 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	MGP	P08493	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	BCL2	P10415	239 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	RAB5C	P51148	216 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		Q6ZNX1	250 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	C15orf54	Q8N8G6	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		Q8N976	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	TPPP3	Q9BW30	176 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304	VAX2	Q9UIW0	290 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ZEB1-223	ENST00000561304		K7EN84	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304		M0QY20	66 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	GNG4	P50150	75 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ZEB1-223	ENST00000561304	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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