RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561204.5

MEIS3-211, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MEIS3, Length 2,195 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-211ENST00000561204 TSPEAR-AS2P59090 65 aa12.79□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 USP24Q9UPU5 2620 aa12.78□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 DEFB131AP59861 70 aa12.78□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM170BQ5T4T1 132 aa12.78□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 CREBBPQ92793 2442 aa12.77□□□□□ -0.36
MEIS3-211ENST00000561204 PTPN13Q12923 2485 aa12.77□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 A0A0J9YY99 117 aa12.77□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.77□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 H3BMG7 143 aa12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 I3L3M4 83 aa12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 HTN1P15515 57 aa12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 Q8N2B8 174 aa12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 C20orf203Q8NBC4 194 aa12.76□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 A8MTW9 85 aa12.76□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 PRM2P04554 102 aa12.75□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 UBE2D1P51668 147 aa12.75□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 DUX3Q96PT4 197 aa12.75□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa12.74□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 RPL24P83731 157 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 Q5PR19 223 aa12.74□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.74□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 A6NJY4 79 aa12.74□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 WFDC2Q14508 124 aa12.74□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM61Q8N0U2 210 aa12.74□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.73□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 EDA2RQ9HAV5 297 aa12.73□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 ABCA12Q86UK0 2595 aa12.73□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 J3QQQ9 107 aa12.72□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 NAV2Q8IVL1 2488 aa12.72□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 SLC25A29Q8N8R3 303 aa12.71□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 TRAV2A0A0B4J234 112 aa12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 TMEM223A0PJW6 202 aa12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 C4orf3Q8WVX3 66 aa12.71□□□□□ -0.37
MEIS3-211ENST00000561204 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 PRO0461Q9UI25 63 aa12.71□□□□□ -0.37
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MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.7□□□□□ -0.38
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MEIS3-211ENST00000561204 Q96MF0 132 aa12.7□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
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MEIS3-211ENST00000561204 M0R2P5 195 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 MTURNQ8N3F0 131 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 FAM104AQ969W3 186 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 VCX2Q9H322 139 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 MAP6D1Q9H9H5 199 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 Q9UF83 564 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 A0A0J9YXV3 536 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 RHODO00212 210 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 TSPAN13O95857 204 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 GAGE13Q4V321 117 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.69□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 MYO9AB2RTY4 2548 aa12.68□□□□□ -0.38
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MEIS3-211ENST00000561204 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.68□□□□□ -0.38
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MEIS3-211ENST00000561204 Q6ZSN1 163 aa12.67□□□□□ -0.38
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MEIS3-211ENST00000561204 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.67□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa12.67□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa12.67□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 CD28P10747 220 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF415Q09FC8 603 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 COTL1Q14019 142 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 ETDBQ3ZM63 59 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 CFC1BP0CG36 223 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 CFC1P0CG37 223 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 CFAP126Q5VTH2 177 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 SFTA2Q6UW10 78 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 C11orf72Q8NBR9 251 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa12.66□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
MEIS3-211ENST00000561204 UBE2D3P61077 147 aa12.64□□□□□ -0.39
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