RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.25□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087WWC5 75 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV21A0A0B4J279 112 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 F6UZH7 168 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF7P21781 194 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 SULT1A1P50225 295 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASB13Q8WXK3 278 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 SH3BGRL3Q9H299 93 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 FLVCR2Q9UPI3 526 aa5.24□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 SEC11BP0C7V7 166 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2WQ96B02 151 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNS1Q96KK3 526 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCL7BQ9BQE9 202 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 C20orf85Q9H1P6 137 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 KLK12Q9UKR0 248 aa5.23□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0D9SG52 128 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A11P31949 105 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 CSN1S1P47710 185 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSTP61278 116 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM252Q8N6L7 170 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM75Q8N9X5 138 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 C2orf50Q96LR7 162 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP5SQ99766 215 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 GSKIPQ9P0R6 139 aa5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0J9YXV3 536 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 L7N2F9 121 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 RANP62826 216 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 HBG1P69891 147 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 HBG2P69892 147 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL19P84098 196 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL15RAQ13261 267 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 PYDC2Q56P42 97 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ENHOQ6UWT2 76 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 STX12Q86Y82 276 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.21□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR7C2O60412 319 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCAP31P51572 246 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP10-8P60410 259 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q0VG73 95 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 TREM1Q9NP99 234 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 OTORQ9NRC9 128 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.2□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 A8MWV9 139 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 HLA-DQA1P01909 254 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ELOBQ15370 118 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATP6V1FQ16864 119 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPV17L2Q567V2 206 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF185Q96GF1 192 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.19□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087WX48 190 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 CHTF8P0CG12 524 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRTAP12-2P59991 146 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 KHDC3LQ587J8 217 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 GCGP01275 180 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 CRPP02741 224 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A10P60903 97 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2D3P61077 147 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBE2D2P62837 147 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNG5P63218 68 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIAQ16674 131 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR2T35Q8NGX2 323 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 HYLS1Q96M11 299 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBD2Q9UBB5 411 aa5.17□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A0U1RRA0 63 aa5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAAR5O14804 337 aa5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 CMTM2Q8TAZ6 248 aa5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL36BQ9NZH7 164 aa5.16□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC17Q685J3 4493 aa5.15□□□□□ -1.58
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.15□□□□□ -1.59
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85 ms