RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 USP17L23D6RBM5 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MIAQ16674 131 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ALG5Q9Y673 324 aa6.07□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LTAP01374 205 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HLA-DQA1P01909 254 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRSS1P07477 247 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MPV17L2Q567V2 206 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MED28Q9H204 178 aa6.06□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PTTG1O95997 202 aa6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FHITP49789 147 aa6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF56Q15929 161 aa6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRR27Q6MZM9 219 aa6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.05□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CXCL1P09341 107 aa6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q5BKY6 102 aa6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CST9LP1Q5W188 147 aa6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLRN3Q8NCR9 226 aa6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PRR34Q9NV39 138 aa6.04□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A0D9SG52 128 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 F5H697 171 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AKR1C3P42330 323 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q6ZRU5 148 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STOML3Q8TAV4 291 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DERL1Q9BUN8 251 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VAX2Q9UIW0 290 aa6.03□□□□□ -1.44
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNAI2O43623 268 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR5AL1P0C617 328 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RBX1P62877 108 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.02□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PANO1I0J062 215 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM17P0DL12 118 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MT1HL1P0DM35 61 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GAGE6Q13070 117 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MLST8Q9BVC4 326 aa6.01□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PAGE4O60829 102 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 P01737 135 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 REG3AQ06141 175 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IQCJQ1A5X6 159 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BAGE2Q86Y30 109 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DPH3Q96FX2 82 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF185Q96GF1 192 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 hDV102S1A0JD36 115 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GZMBP10144 247 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AP1S3Q96PC3 154 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AP5S1Q9NUS5 200 aa5.99□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1B0GUV1 79 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H7C1H1 209 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PFDN1O60925 122 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSTP61278 116 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.98□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A087WYN8 130 aa5.97□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 M0QY20 66 aa5.97□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARPC5O15511 151 aa5.97□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMUB2Q71RG4 321 aa5.97□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.97□□□□□ -1.45
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UMAD1C9J7I0 102 aa5.96□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MGPP08493 103 aa5.96□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.96□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C7orf33Q8WU49 177 aa5.96□□□□□ -1.46
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM243Q9BU79 118 aa5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 263.6 ms