RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 KLK12Q9UKR0 248 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 NDUFS5O43920 106 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 RNF183Q96D59 192 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV2-8P01709 118 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV12-3P01733 135 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 K7ERJ3 54 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 C16orf95Q9H693 158 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GX51 115 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
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PTPRB-208ENST00000550358 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 MAJINQ3KP22 176 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CRIP3Q6Q6R5 217 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 NRGNQ92686 78 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 ASXL3Q9C0F0 2248 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 COX17Q14061 63 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TDRG1Q3Y452 100 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 SVILO95425 2214 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CRYGDP07320 174 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 NCR3O14931 201 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM223A0PJW6 202 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LELP1Q5T871 98 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 PTH2Q96A98 100 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LY6G6DO95868 133 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 PLA2G2AP14555 144 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZUT4 128 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 C7orf33Q8WU49 177 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 PROP1O75360 226 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 WFDC11Q8NEX6 87 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-208ENST00000550358 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.35□□□□□ -1.39
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PTPRB-208ENST00000550358 KLLNB2CW77 178 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 M0QY20 66 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 SDK2Q58EX2 2172 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZTI0 123 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 C9orf85Q96MD7 179 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00643Q86TS7 51 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf173Q96LM9 149 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 LECT2O14960 151 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRB-208ENST00000550358 INAFM1C9JVW0 142 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ALPK3Q96L96 1907 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01006Q8NI28 216 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 NUPR2A6NF83 97 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 FOXI1Q12951 378 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 UPK3BQ9BT76 320 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LRP4O75096 1905 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 CNFNQ9BYD5 112 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ESPL1Q14674 2120 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 FXYD2P54710 66 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZPA2 131 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 DNAJC13O75165 2243 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 M0R378 163 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 SYCNQ0VAF6 134 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N976 141 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRB-208ENST00000550358 CACNA1EQ15878 2313 aa6.31□□□□□ -1.4
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