RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545889.5

CLIP1-218, Transcript of CAP-Gly domain containing linker protein 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLIP1, Length 4,633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-218ENST00000545889 KRTAP10-9P60411 292 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF503Q96F45 646 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.68□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 TRAV25A0A0B4J276 109 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 SMKR1H3BMG3 65 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 XCL1P47992 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CLIP1-218ENST00000545889 FXYD2P54710 66 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLIP1-218ENST00000545889 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 LTAP01374 205 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 IGLV1-47P01700 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 Q6YL49 198 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 Q6ZSV7 163 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 KLK12Q9UKR0 248 aa6.61□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.6□□□□□ -1.35
CLIP1-218ENST00000545889 LY6G6CO95867 125 aa6.6□□□□□ -1.35
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