RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 K7ERJ3 54 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 POLEQ07864 2286 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 BAALCQ8WXS3 180 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 CACNA1DQ01668 2161 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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PTPRB-204ENST00000538708 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
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PTPRB-204ENST00000538708 EBI3Q14213 229 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 H3BQ85 93 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 LECT2O14960 151 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 CRYGBP07316 175 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 IFITM1P13164 125 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-204ENST00000538708 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZUT4 128 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF747Q9BV97 191 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-204ENST00000538708 CFC1P0CG37 223 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 IGLC3P0DOY3 106 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRB-204ENST00000538708 H0Y9J4 135 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRB-204ENST00000538708 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 CTRLP40313 264 aa7.09□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 KIR2DL5AQ8N109 375 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 U3KQK5 164 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 H0YGX0 51 aa7.08□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 RETNQ9HD89 108 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01545Q5VT33 79 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.07□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 PYY3Q5JQD4 70 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 PTPRSQ13332 1948 aa7.06□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 C11orf86A6NJI1 115 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 RS1O15537 224 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 LINC00467Q9BRT7 94 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 IGLV1-40P01703 118 aa7.05□□□□□ -1.28
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PTPRB-204ENST00000538708 C16orf95Q9H693 158 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N6K4 173 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 PKDREJQ9NTG1 2253 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 PCP4P48539 62 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 UBE2V1Q13404 147 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 F8W1H4 67 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1W2PPM0 123 aa7.03□□□□□ -1.28
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