RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515143.5

SPOCK3-223, Transcript of SPARC (osteonectin), cwcv and kazal like domains proteoglycan 3, human

TSL 4

Gene SPOCK3, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPOCK3-223	ENST00000515143		F2Z2F3	143 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		M0R381	172 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PDE6D	O43924	150 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PFDN1	O60925	122 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	NDUFS6	O75380	124 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q5VSD8	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	ENHO	Q6UWT2	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	DNAJC30	Q96LL9	226 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q9HAA7	133 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A1B0GUV1	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		M0QY20	66 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SLC51B	Q86UW2	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	BIN3	Q9NQY0	253 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A087WX48	190 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	CACNG7	P62955	275 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143		Q6ZNX1	250 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	BAALC	Q8WXS3	180 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	XKRY2	A2RUG3	117 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	MIA	Q16674	131 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	CENPW	Q5EE01	88 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	CHAC1	Q9BUX1	264 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SPOCK3-223	ENST00000515143	RAB19	A4D1S5	217 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143		H7C1H1	209 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	BCL2	P10415	239 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	CTRL	P40313	264 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	MPV17L2	Q567V2	206 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.71	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM250	H0YL14	139 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143		P01737	135 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	GZMB	P10144	247 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	NTF3	P20783	257 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	GNG4	P50150	75 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	RBX1	P62877	108 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	ZNF56	Q15929	161 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	FAM231D	Q6ZW35	169 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	NUDT10	Q8NFP7	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	OCC1	Q8TAD7	63 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	UBE2W	Q96B02	151 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	MED9	Q9NWA0	146 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143		A0A1B0GV50	99 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	TMEM262	E9PQX1	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143		F5H697	171 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	IFNA1	P01562	189 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	TRGC1	P0CF51	173 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	C1orf43	Q9BWL3	253 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPOCK3-223	ENST00000515143	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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