RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513618.1

SPATA20-223, Transcript of spermatogenesis associated 20, human

TSL 2

Gene SPATA20, Length 629 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA20-223	ENST00000513618	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	PAGE4	O60829	102 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	SMIM17	P0DL12	118 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	RBX1	P62877	108 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618	DERL1	Q9BUN8	251 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A0D9SG52	128 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	BAGE2	Q86Y30	109 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	MLST8	Q9BVC4	326 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	PFDN1	O60925	122 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	AP1S3	Q96PC3	154 aa		11.32	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	ARPC5	O15511	151 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	GAGE6	Q13070	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618		Q6ZRU5	148 aa		11.31	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618		P01737	135 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	REG3A	Q06141	175 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	MBD3L1	Q8WWY6	194 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		11.3	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618		H7C1H1	209 aa		11.29	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618		G3V3Q6	166 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	RNF185	Q96GF1	192 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	BATF3	Q9NR55	127 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	AP5S1	Q9NUS5	200 aa		11.28	□□□□□ -0.6
SPATA20-223	ENST00000513618	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1B0GUV1	79 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PANO1	I0J062	215 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	GZMB	P10144	247 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SST	P61278	116 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TMUB2	Q71RG4	321 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.27	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		M0QY20	66 aa		11.26	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MGP	P08493	103 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MT1HL1	P0DM35	61 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	ZNF345	Q14585	488 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	KCNRG	Q8N5I3	272 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	DPH3	Q96FX2	82 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A1B0GV50	99 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RPS20	P60866	119 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	CACNG7	P62955	275 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TMEM243	Q9BU79	118 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	SUMO4	Q6EEV6	95 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	PGLYRP4	Q96LB8	373 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLC6	P0CF74	106 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	WDR73	Q6P4I2	378 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	TPPP3	Q9BW30	176 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		A0A087WYN8	130 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618		F2Z2F3	143 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	NKX2-5	P52952	324 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SPATA20-223	ENST00000513618	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	XKRY2	A2RUG3	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	UBE2L6	O14933	153 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	TRGC1	P0CF51	173 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	CFAP161	Q6P656	301 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	OR2D3	Q8NGH3	330 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	C11orf52	Q96A22	123 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	SMIM12	Q96EX1	92 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	NIT2	Q9NQR4	276 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	SLPI	P03973	132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	C7orf33	Q8WU49	177 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	SULT1A2	P50226	295 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	RAB5C	P51148	216 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	CENPW	Q5EE01	88 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SPATA20-223	ENST00000513618	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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