RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498189.1

BBS9-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 9, human

TSL 2

Gene BBS9, Length 614 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS9-215	ENST00000498189	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	CXCL1	P09341	107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	GNG5	P63218	68 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	LINC00477	Q96M19	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SH3BGRL3	Q9H299	93 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	RCL1	Q9Y2P8	373 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	C7orf71	A4D174	169 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	UMAD1	C9J7I0	102 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	CSN1S1	P47710	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	FXYD7	P58549	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TAS2R45	P59539	299 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	ADIRF	Q15847	76 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SPINK13	Q1W4C9	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	LYPD1	Q8N2G4	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	NMES1	Q9C002	83 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	USP17L23	D6RBM5	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189		F6UB75	175 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	HTN3	P15516	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189		Q6ZVH6	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	C18orf15	Q96N68	181 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	MGST2	Q99735	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	PRADC1	Q9BSG0	188 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	RBAKDN	A6NC62	111 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	CRX	O43186	299 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	CD164	Q04900	197 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189		Q6Q795	121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	ST20	Q9HBF5	79 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.91	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.9	□□□□□ -1.62
BBS9-215	ENST00000498189	TRBV19	A0A075B6N1	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ATP5L	O75964	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	CST7	O76096	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GPX1	P07203	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SEC11A	P67812	179 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	FOXI1	Q12951	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TMEM37	Q8WXS4	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GNPNAT1	Q96EK6	184 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	ATP5S	Q99766	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		C9JQL5	133 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		F8W1H4	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		H3BRM9	83 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RHOD	O00212	210 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	HTN1	P15515	57 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	CRISP2	P16562	243 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	PMCHL1	Q16048	86 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	MIC13	Q5XKP0	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189		Q6ZR54	194 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBS9-215	ENST00000498189	TVP23C	Q96ET8	276 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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