RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 M0R381 172 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CTRLP40313 264 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 ERVFC1-1P60608 527 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 ADIRFQ15847 76 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 UFSP1Q6NVU6 142 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 UQCC3Q6UW78 93 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SFRP2Q96HF1 295 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 OSTCQ9NRP0 149 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 V9GYV3 84 aa5.07□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0J9YY99 117 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM218A2RU14 115 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SLPIP03973 132 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CRYGDP07320 174 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 MT1HL1P0DM35 61 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CRYBA4P53673 196 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CT83Q5H943 113 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 LELP1Q5T871 98 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 ZFP82Q8N141 532 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 OR4C5Q8NGB2 326 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 MSRB1Q9NZV6 116 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.06□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A0A096LPF7 62 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 XKRY2A2RUG3 117 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A8MWL6 223 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A8MWV9 139 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 H3BNG1 76 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SSTP61278 116 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 ESRGQ1W209 222 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TTC32Q5I0X7 151 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TPPP3Q9BW30 176 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CNFNQ9BYD5 112 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 Q9UF83 564 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PRO0255Q9UI72 69 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087WWL8 130 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PPQ1 181 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 F2Z2F3 143 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 F8W036 122 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 GAS8-AS1O95177 125 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 NTF3P20783 257 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00315P59091 139 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TSKUQ8WUA8 353 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PGLYRP4Q96LB8 373 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SEC11CQ9BY50 192 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.04□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 LPAP08519 4548 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 FAM231BA6NCW3 169 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 HIGD1CA8MV81 97 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 K7EQD1 137 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CIDEAO60543 219 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CACNG7P62955 275 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 WDR73Q6P4I2 378 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 NUP35Q8NFH5 326 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
C9orf135-204ENST00000495399 RHODO00212 210 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00694P0DN24 101 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 GYPEP15421 78 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 EVI2AP22794 236 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 SLAQ13239 276 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 AP1S3Q96PC3 154 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 UPK3BQ9BT76 320 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM70Q9BUB7 260 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.02□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 GCSHP23434 173 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 RAB4BP61018 213 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 RHOHQ15669 191 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 TWIST1Q15672 202 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.01□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1B0GUT8 65 aa5□□□□□ -1.61
C9orf135-204ENST00000495399 TRGC1P0CF51 173 aa5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms