RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495217.1

PRDM15-215, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 703 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-215ENST00000495217 CXCL1P09341 107 aa8.35□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 AKR1C3P42330 323 aa8.35□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.35□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 G3V3Q6 166 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 SNAI2O43623 268 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 PKIAP61925 76 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 VAX2Q9UIW0 290 aa8.34□□□□□ -1.07
PRDM15-215ENST00000495217 ATP6V1G1O75348 118 aa8.33□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 MT1HL1P0DM35 61 aa8.33□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 CST9LP1Q5W188 147 aa8.33□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.33□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.33□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 OR5AL1P0C617 328 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 RBX1P62877 108 aa8.32□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.32□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.31□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa8.31□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 S100A1P23297 94 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 AP1S3Q96PC3 154 aa8.3□□□□□ -1.08
PRDM15-215ENST00000495217 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.29□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 S100A9P06702 114 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PRDM15-215ENST00000495217 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.27□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 SLPIP03973 132 aa8.25□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 IGLC6P0CF74 106 aa8.25□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 CHTF8P0CG12 524 aa8.25□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 SSTP61278 116 aa8.25□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.25□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 RNF185Q96GF1 192 aa8.24□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 P01737 135 aa8.23□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 C11orf52Q96A22 123 aa8.23□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 TMEM243Q9BU79 118 aa8.23□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 SMLR1H3BR10 107 aa8.22□□□□□ -1.09
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PRDM15-215ENST00000495217 TPPP3Q9BW30 176 aa8.22□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 RNF213Q63HN8 5207 aa8.22□□□□□ -1.09
PRDM15-215ENST00000495217 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 IFITM2Q01629 132 aa8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 CENPWQ5EE01 88 aa8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 C15orf56Q8N910 161 aa8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 AP5S1Q9NUS5 200 aa8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.21□□□□□ -1.1
PRDM15-215ENST00000495217 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.2□□□□□ -1.1
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