RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
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PRPF40A-210ENST00000489741 IL36BQ9NZH7 164 aa4.14□□□□□ -1.75
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PRPF40A-210ENST00000489741 TCEAL7Q9BRU2 100 aa4.08□□□□□ -1.76
PRPF40A-210ENST00000489741 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa4.08□□□□□ -1.76
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PRPF40A-210ENST00000489741 TPT1P13693 172 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
PRPF40A-210ENST00000489741 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
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