RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 M0QY20 66 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TRGC1P0CF51 173 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TSKUQ8WUA8 353 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.2□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 HIGD1CA8MV81 97 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 GAS8-AS1O95177 125 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 S100A1P23297 94 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 GATD1Q8NB37 220 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 NUP35Q8NFH5 326 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 A0A1B0GUT8 65 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 LINC00862A6NCI5 91 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 RASL11AQ6T310 242 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 DNAJC30Q96LL9 226 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WWC5 75 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 FAM231BA6NCW3 169 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 COMMD7Q86VX2 200 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 NIT1Q86X76 327 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 RNF185Q96GF1 192 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 NIT2Q9NQR4 276 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-210ENST00000488157 PKD1P98161 4303 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 H7C1H1 209 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 UQCC3Q6UW78 93 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 BORCS7Q96B45 105 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 Q9HAA7 133 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 ADCYAP1P18509 176 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 BTF3P20290 206 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 AMN1Q8IY45 258 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 NAT8BQ9UHF3 227 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 K7EP13 123 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 RAB4AP20338 218 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 RIGQ13278 110 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 KLK12Q9UKR0 248 aa8.12□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 TMEM262E9PQX1 116 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 SMKR1H3BMG3 65 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 CAMPP49913 170 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP10-2P60368 255 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 GAGE6Q13070 117 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 MPV17L2Q567V2 206 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 NFE4Q86UQ8 179 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.11□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 TMEM218A2RU14 115 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 NCR2O95944 276 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 ATRAIDQ6UW56 229 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 Q8N976 141 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.1□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WTM6 91 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 A0A087WX48 190 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 IQCJQ1A5X6 159 aa8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NISCH-210ENST00000488157 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 A0A1B0GXF2 115 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 F8W036 122 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 LAGE3Q14657 143 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 TMEM97Q5BJF2 176 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 ENHOQ6UWT2 76 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 FRZBQ92765 325 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 UBE2WQ96B02 151 aa8.08□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 PPP1R2P9O14990 202 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 MT-ND4LP03901 98 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 RBX1P62877 108 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 COTL1Q14019 142 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 WFDC2Q14508 124 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 FAM104BQ5XKR9 115 aa8.07□□□□□ -1.12
NISCH-210ENST00000488157 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 190.7 ms