RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C20orf173Q96LM9 149 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 CST9LQ9H4G1 147 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 A0A0J9YXV3 536 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 MED14OSP0DP75 135 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 CRIP1P50238 77 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C5orf47Q569G3 176 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 Q6ZSV7 163 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 TSPAN13O95857 204 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 IGLC6P0CF74 106 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C16orf74Q96GX8 76 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.55□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 KRTAP10-9P60411 292 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 ESM1Q9NQ30 184 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 K7ERJ3 54 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 HERVK_113P63121 156 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 NXPH4O95158 308 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 Q6ZVH6 145 aa7.54□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C9orf118A6NHY6 69 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C9JAW5 83 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 MRAPQ8TCY5 172 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 YPEL4Q96NS1 127 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 SIVA1O15304 175 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 DEFB135Q30KP9 77 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 C2orf82Q6UX34 121 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.53□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.52□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 PSCAO43653 123 aa7.52□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 GYPEP15421 78 aa7.52□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 PSMB8P28062 276 aa7.52□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
STRC-211ENST00000485556 LGALS9O00182 355 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 IGLV2-11P01706 119 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 XCL1P47992 114 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 Q6ZQT7 251 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 CEND1Q8N111 149 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 K7EQD1 137 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DEFB4AO15263 64 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 CRLF1O75462 422 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 INAFM1C9JVW0 142 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 H3BMM0 161 aa7.52□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ADAMTS20P59510 1910 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C5orf38Q86SI9 138 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 GHRHP01286 108 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DEFB125Q8N687 156 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ZNF702PQ9H963 129 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.51□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TAL2Q16559 108 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 Q9H8V8 135 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ATP5G1P05496 136 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 FGF6P10767 208 aa7.5□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ETDBQ3ZM63 59 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 AMTNQ6UX39 209 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 BAALCQ8WXS3 180 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 SIGMAR1Q99720 223 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C12orf74Q32Q52 190 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 UBE2WQ96B02 151 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TOMM6Q96B49 74 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.49□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 IGLV1-40P01703 118 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 P0DMU3 169 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 FAM231AP0DMU4 169 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 FAM231CP0DMU5 169 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 RBX1P62877 108 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TIMM17AQ99595 171 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 A0A1W2PPM0 123 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C11orf86A6NJI1 115 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 ODF3Q96PU9 254 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 Q6ZTI0 123 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.48□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.47□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.47□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 H3BMG7 143 aa7.47□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 INSL3P51460 131 aa7.47□□□□□ -1.21
STRC-211ENST00000485556 LINC01006Q8NI28 216 aa7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.8 ms