RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484134.5

RPUSD3-216, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,491 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD3-216ENST00000484134 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 M0R2P5 195 aa14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 ZNF56Q15929 161 aa14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.64□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE5Q13069 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE6Q13070 117 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 C9orf85Q96MD7 179 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 A0A0J9YXY3 114 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 B5MCH6 92 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 Q1RN00 199 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.63□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 SORL1Q92673 2214 aa14.62□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa14.62□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 C20orf203Q8NBC4 194 aa14.62□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 TRIAP1O43715 76 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 PF4V1P10720 104 aa14.61□□□□□ -0.07
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RPUSD3-216ENST00000484134 ATXN8Q156A1 80 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 LY6EQ16553 131 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE2EQ4V326 116 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE2DQ9UEU5 116 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 RHOHQ15669 191 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 DCANP1Q8TF63 244 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 ODF3Q96PU9 254 aa14.61□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 LITAFQ99732 161 aa14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 IGKV3-20P01619 116 aa14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 USMG5Q96IX5 58 aa14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 IGF2RP11717 2491 aa14.6□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 SNCGO76070 127 aa14.59□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 FAM104AQ969W3 186 aa14.59□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 SPXQ9BT56 116 aa14.59□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 A0A0J9YX75 114 aa14.59□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.58□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 BLCAPP62952 87 aa14.58□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 LINC01600Q96MT4 127 aa14.58□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa14.58□□□□□ -0.07
RPUSD3-216ENST00000484134 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa14.58□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 Q6ZSV7 163 aa14.57□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 BRI3O95415 125 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHG2P01859 326 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CCDC179H3BU77 68 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 I3L3M4 83 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 PRSS2P07478 247 aa14.56□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 FOXC1Q12948 553 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ID1P41134 155 aa14.55□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 C15orf53Q8NAA6 179 aa14.54□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 H7C423 109 aa14.54□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 A8MZ25 164 aa14.53□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 H3BUA1 57 aa14.53□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 TIMM21Q9BVV7 248 aa14.53□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.53□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 H3BMM0 161 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 IGLV1-40P01703 118 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 IFITM1P13164 125 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 C2orf82Q6UX34 121 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 UBE2WQ96B02 151 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 ICOSQ9Y6W8 199 aa14.52□□□□□ -0.08
RPUSD3-216ENST00000484134 H3BUX3 64 aa14.52□□□□□ -0.09
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RPUSD3-216ENST00000484134 NPC2P61916 151 aa14.52□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 SPINK13Q1W4C9 94 aa14.52□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 TTC32Q5I0X7 151 aa14.52□□□□□ -0.09
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RPUSD3-216ENST00000484134 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 CLEC2BQ92478 149 aa14.51□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE12JA6NER3 117 aa14.5□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 GAGE7O76087 117 aa14.5□□□□□ -0.09
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RPUSD3-216ENST00000484134 CD28P10747 220 aa14.5□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 Q6Q795 121 aa14.5□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 Q9UF83 564 aa14.5□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 A6NDX4 124 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 K7EMT4 169 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 NDUFA12Q9UI09 145 aa14.49□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 TMEM95Q3KNT9 176 aa14.48□□□□□ -0.09
RPUSD3-216ENST00000484134 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa14.48□□□□□ -0.09
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