RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 LINC01551Q86U37 167 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 Q9HAA7 133 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SUMO4Q6EEV6 95 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 BORCS7Q96B45 105 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CNFNQ9BYD5 112 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SMDT1Q9H4I9 107 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WX48 190 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 LAGE3Q14657 143 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CT83Q5H943 113 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 NIT1Q86X76 327 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GTSF1Q8WW33 167 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PGLYRP4Q96LB8 373 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OSTCQ9NRP0 149 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM262E9PQX1 116 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 M0QY20 66 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 RASL11AQ6T310 242 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 Q8N3U1 123 aa12.96□□□□□ -0.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB14P61106 215 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 IFITM2Q01629 132 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ELOBQ15370 118 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CHCHD7Q9BUK0 85 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TM2D2Q9BX73 214 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A087WTM6 91 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TSKUQ8WUA8 353 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NAT8Q9UHE5 227 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 C9JQL5 133 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP10-2P60368 255 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ADIRFQ15847 76 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NIT2Q9NQR4 276 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PKD1P98161 4303 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PKIAP61925 76 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ISOC2Q96AB3 205 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 KLK12Q9UKR0 248 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 FAM231BA6NCW3 169 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 HIGD1CA8MV81 97 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RMI2Q96E14 147 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GUT8 65 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FRZBQ92765 325 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2WQ96B02 151 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 COX11Q9Y6N1 276 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 V9GYV3 84 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CLLU1Q5K131 121 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 GATD1Q8NB37 220 aa12.88□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 Q0VG73 95 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 RIGQ13278 110 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 GAGE6Q13070 117 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 IQCJQ1A5X6 159 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 MPV17L2Q567V2 206 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 ATRAIDQ6UW56 229 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 PKHD1P08F94 4074 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 CRPP02741 224 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 COTL1Q14019 142 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP35Q8NFH5 326 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 NAT8BQ9UHF3 227 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAH11Q96DT5 4516 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM243Q9BU79 118 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM191AQ9H0A3 160 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP4-209ENST00000484097 Q8N976 141 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 UBE2L6O14933 153 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 AMTP48728 403 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 RBX1P62877 108 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK2AP2O75956 126 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 Q8N814 137 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 C1orf43Q9BWL3 253 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB4AP20338 218 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 ENHOQ6UWT2 76 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 BAALCQ8WXS3 180 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 SDHAF1A6NFY7 115 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP4-209ENST00000484097 PMCHP20382 165 aa12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.5 ms