RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 PSMB2P49721 201 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 ODF3Q96PU9 254 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 JPT2Q9H910 190 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 C19orf84I3L1E1 186 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 EMP1P54849 157 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.49□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.49□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 LY6DQ14210 128 aa6.48□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 ZNF56Q15929 161 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.48□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 ZNF876PQ49A33 203 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 C9orf85Q96MD7 179 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.48□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 B5MCH6 92 aa6.47□□□□□ -1.37
PKP4-210ENST00000480171 H3BS24 57 aa6.47□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.47□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 J3QQQ9 107 aa6.47□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa6.46□□□□□ -1.37
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.46□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 M0QY20 66 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 LEPROTO15243 131 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 IGKV3-20P01619 116 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.46□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 CFC1P0CG37 223 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 INSL3P51460 131 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 MDFICQ9P1T7 246 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SPG11Q96JI7 2443 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TRGV11A0A075B6L2 103 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 I3L3M4 83 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 K7EQG2 157 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 PSMB8P28062 276 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.45□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 Q8N1Y9 231 aa6.45□□□□□ -1.38
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PKP4-210ENST00000480171 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TMEM223A0PJW6 202 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 A8MWV9 139 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 B4DSR2 109 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.44□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TCL1BO95988 128 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TEN1Q86WV5 123 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 AMELXQ99217 191 aa6.43□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 RHODO00212 210 aa6.42□□□□□ -1.38
PKP4-210ENST00000480171 ERG28Q9UKR5 140 aa6.42□□□□□ -1.38
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