RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 K7EP13 123 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBE2D3P61077 147 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBE2D2P62837 147 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LELP1Q5T871 98 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 Q9UF83 564 aa13.33□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SIVA1O15304 175 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RHEBQ15382 184 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CLRN3Q8NCR9 226 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BTF3L4Q96K17 158 aa13.32□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPP1R17O96001 155 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RAB4AP20338 218 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HBBP68871 147 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNIP4Q6PIL6 250 aa13.31□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C7orf77A4D0Y5 90 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CAMPP49913 170 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SVBPQ8N300 66 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GATD1Q8NB37 220 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRAP2Q96G30 205 aa13.3□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SNAPINO95295 136 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 APOC3P02656 99 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 S100PP25815 95 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OR10J3Q5JRS4 329 aa13.29□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A1B0GXF2 115 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 BTF3P20290 206 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TTC32Q5I0X7 151 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM104BQ5XKR9 115 aa13.28□□□□□ -0.28
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 AMN1Q8IY45 258 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RNF185Q96GF1 192 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.27□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa13.26□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 Q6ZR54 194 aa13.25□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PPBPP02775 128 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DNAH10OSP0CZ25 163 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PKIAP61925 76 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C10orf126Q8N4M7 172 aa13.24□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 M0R2N4 97 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CKS2P33552 79 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COX19Q49B96 90 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ST20Q9HBF5 79 aa13.23□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC01556Q5JQF7 62 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 WFDC10BQ8IUB3 73 aa13.22□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHCHD7Q9BUK0 85 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa13.21□□□□□ -0.29
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NCR2O95944 276 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 COTL1Q14019 142 aa13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SDHAF1A6NFY7 115 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 I3L3M4 83 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VCYO14598 125 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PHOX2AO14813 284 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PMCHP20382 165 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ELOBQ15370 118 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IQCJQ1A5X6 159 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C1orf134Q5TEV5 83 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C20orf78Q9BR46 151 aa13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ALMS1Q8TCU4 4167 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM136Q6ZRR5 245 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.18□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A087WX48 190 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM262E9PQX1 116 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NIT1Q86X76 327 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ORMDL3Q8N138 153 aa13.17□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VPS13DQ5THJ4 4388 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NFE4Q86UQ8 179 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C6orf223Q8N319 242 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NRACQ8N912 160 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM70Q9BUB7 260 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 GNB1LQ9BYB4 327 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa13.16□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TCAPO15273 167 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL32P62910 135 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00336Q6ZUF6 198 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM243Q9BU79 118 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 DNAH1Q9P2D7 4330 aa13.15□□□□□ -0.3
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LYSTQ99698 3801 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SACSQ9NZJ4 4579 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 D6R8Y8 96 aa13.14□□□□□ -0.31
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SMKR1H3BMG3 65 aa13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms