RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466996.5

LNP1-202, Transcript of leukemia NUP98 fusion partner 1, humanhuman

TSL 5

Gene LNP1, Length 1,723 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNP1-202ENST00000466996 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 VCYO14598 125 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 CRYGDP07320 174 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 RIPPLY3P57055 190 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 SYT8Q8NBV8 401 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.4□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 AGRNO00468 2067 aa7.39□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 DNHD1Q96M86 4753 aa7.39□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.39□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 IGIPA6NJ69 53 aa7.39□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 ZNF56Q15929 161 aa7.39□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.38□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 G3V4G9 280 aa7.38□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 SPINK13Q1W4C9 94 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 RRN3P1Q2M238 152 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 KIR2DL4Q99706 377 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 COL6A5A8TX70 2615 aa7.38□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 HERVK_113P61574 105 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 SCGB2A2Q13296 93 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 Q8N1Y9 231 aa7.38□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 TIMM17AQ99595 171 aa7.38□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 Q6YL49 198 aa7.36□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.34□□□□□ -1.23
LNP1-202ENST00000466996 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.34□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.34□□□□□ -1.23
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LNP1-202ENST00000466996 A6NJY4 79 aa7.33□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
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LNP1-202ENST00000466996 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.33□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.33□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 H3BMG7 143 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 WFDC2Q14508 124 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 NFE4Q86UQ8 179 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 F8W1H4 67 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 I3L3M4 83 aa7.32□□□□□ -1.24
LNP1-202ENST00000466996 TSPAN13O95857 204 aa7.32□□□□□ -1.24
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