RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 FRZBQ92765 325 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.99□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 PHOX2AO14813 284 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 HLA-DQA1P01909 254 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFA6P56556 154 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 DNLZQ5SXM8 178 aa8.98□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 SPATA12Q7Z6I5 190 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa8.97□□□□□ -0.97
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GW15 77 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 RHOHQ15669 191 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 NFE4Q86UQ8 179 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 OR2D3Q8NGH3 330 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 PRADC1Q9BSG0 188 aa8.96□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 A8MWV9 139 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 CDK2AP2O75956 126 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 EVI2AP22794 236 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 ASIPP42127 132 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 AKR1D1P51857 326 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-2P60368 255 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 BORCS7Q96B45 105 aa8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 HERC1Q15751 4861 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 HSPG2P98160 4391 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 HIGD1CA8MV81 97 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 SH2D1AO60880 128 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 S100A2P29034 98 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZSN1 163 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 NUP35Q8NFH5 326 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.94□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 HBBP68871 147 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01559Q495D7 138 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 DMRTA1Q5VZB9 504 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.93□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM6P0DI80 62 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 RAB4BP61018 213 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 RIGQ13278 110 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 JPT2Q9H910 190 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GXF2 115 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 H3BVH4 76 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 APCSP02743 223 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 CRYGDP07320 174 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00694P0DN24 101 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 LELP1Q5T871 98 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WTM6 91 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GUT8 65 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 Q0VG73 95 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 SYT8Q8NBV8 401 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 Q9UF83 564 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-210ENST00000462125 RHODO00212 210 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 EREGO14944 169 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GATD1Q8NB37 220 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GTSF1Q8WW33 167 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM18Q96B42 140 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 PGLYRP4Q96LB8 373 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE12JA6NER3 117 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE1Q13065 139 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE4Q13068 117 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE5Q13069 117 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 GAGE13Q4V321 117 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 F2Z2F3 143 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-210ENST00000462125 ESDP10768 282 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.4 ms