RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460328.5

TTC3-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, humanhuman

TSL 3

Gene TTC3, Length 573 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3-211ENST00000460328 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 PIRTP0C851 137 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 SPRR1AP35321 89 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 UBE2D1P51668 147 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 PTPN13Q12923 2485 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.63□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 YPEL1O60688 119 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 PITX3O75364 302 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 NBEAP1P0C6P0 100 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.64□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 H0YJX3 145 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 BCE1O60756 84 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 S100A7L2Q5SY68 101 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 Q5VSD8 79 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 SCN3BQ9NY72 215 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.65□□□□□ -2.51
TTC3-211ENST00000460328 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 IGLC6P0CF74 106 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 S100A5P33763 92 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 NCS1P62166 190 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CCDC153Q494R4 210 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 Q8IZM0 81 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 AIF1LQ9BQI0 150 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 RPRMQ9NS64 109 aa-0.66□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 LAMC1P11047 1609 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 NCOR1O75376 2440 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 MYH13Q9UKX3 1938 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 HERC1Q15751 4861 aa-0.67□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 LINC00694P0DN24 101 aa-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 LINC00312Q9Y6C7 94 aa-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 MORN2Q502X0 79 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 Q6ZUT4 128 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SMIM3Q9BZL3 60 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 BSNQ9UPA5 3926 aa-0.69□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ZNF292O60281 2723 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 USH2AO75445 5202 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 C10orf71Q711Q0 1435 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 LRP6O75581 1613 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 PLXNB2O15031 1838 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CREBBPQ92793 2442 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 A6NIN4 97 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 PIN1P1O15428 100 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 IL5P05113 134 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 FAT1Q14517 4588 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 TENM2Q9NT68 2774 aa-0.7□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 AKAP6Q13023 2319 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 VWFP04275 2813 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 NPFFO15130 113 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 DBIP07108 87 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 Q5VV11 94 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 MMGT1Q8N4V1 131 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.71□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ZNF609O15014 1411 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ZNF236Q9UL36 1845 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 K7EQZ3 153 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 IFNA17P01571 189 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 SMIM6P0DI80 62 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 NEFHP12036 1026 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 CCL18P55774 89 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 TAC4Q86UU9 113 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 ADGRB1O14514 1584 aa-0.72□□□□□ -2.52
TTC3-211ENST00000460328 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.72□□□□□ -2.53
TTC3-211ENST00000460328 HERC2O95714 4834 aa-0.72□□□□□ -2.53
TTC3-211ENST00000460328 BCL9LQ86UU0 1499 aa-0.73□□□□□ -2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 119.6 ms