RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 UBE2WQ96B02 151 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD7Q9BUK0 85 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.49□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 CXCL1P09341 107 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAJINQ3KP22 176 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 CST9LP1Q5W188 147 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N976 141 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 TCEAL7Q9BRU2 100 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHAC1Q9BUX1 264 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 COX11Q9Y6N1 276 aa5.48□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB4BP61018 213 aa5.47□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF345Q14585 488 aa5.47□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 RMI2Q96E14 147 aa5.47□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 VAX2Q9UIW0 290 aa5.47□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.47□□□□□ -1.53
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A087WX48 190 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GV50 99 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBFOX3A6NFN3 312 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 PANO1I0J062 215 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV2-8P01709 118 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 OR5AL1P0C617 328 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC11BP0C7V7 166 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF56Q15929 161 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 DERL1Q9BUN8 251 aa5.46□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRSS1P07477 247 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLC6P0CF74 106 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q0VG73 95 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOBQ15370 118 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C15orf54Q8N8G6 183 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 STOML3Q8TAV4 291 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM213BQ8TBF2 198 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SFT2D1Q8WV19 159 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 PRR34Q9NV39 138 aa5.45□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 HMSDA8MTL9 139 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 USP17L23D6RBM5 183 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 GZMBP10144 247 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CCL20P78556 96 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 BAGE2Q86Y30 109 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C11orf52Q96A22 123 aa5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TNXBP22105 4242 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C19orf71A6NCJ1 209 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 UMAD1C9J7I0 102 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM262E9PQX1 116 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 M0QY20 66 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 BCL2L11O43521 198 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 HLA-DQA1P01909 254 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 ANGP03950 147 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPL35P42766 123 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 RBX1P62877 108 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIAQ16674 131 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 RGS21Q2M5E4 152 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CLPSL2Q6UWE3 100 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMUB2Q71RG4 321 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CRPP02741 224 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSTP61278 116 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAGE6Q13070 117 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 IQCJQ1A5X6 159 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD5Q9BSY4 110 aa5.42□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0D9SG52 128 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 F5H697 171 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 PFDN1O60925 122 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLPIP03973 132 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf177Q52M58 125 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 CENPWQ5EE01 88 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00269Q8N2A0 174 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 AP1S3Q96PC3 154 aa5.41□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 RAB19A4D1S5 217 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 OXTP01178 125 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT1HL1P0DM35 61 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 TMEM97Q5BJF2 176 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 KCNIP4Q6PIL6 250 aa5.4□□□□□ -1.54
GAPDHP28-201ENST00000455134 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.4□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.9 ms