RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 BAGE2Q86Y30 109 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 MBD3L1Q8WWY6 194 aa6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PFDN1O60925 122 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CRPP02741 224 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MLST8Q9BVC4 326 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 UMAD1C9J7I0 102 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 USP17L23D6RBM5 183 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SNAI2O43623 268 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CXCL1P09341 107 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 OR5AL1P0C617 328 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF345Q14585 488 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 C14orf177Q52M58 125 aa6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 HLA-DQA1P01909 254 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 H2AFB1P0C5Y9 115 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 GAGE6Q13070 117 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TMUB2Q71RG4 321 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 DERL1Q9BUN8 251 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 HMSDA8MTL9 139 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 BCL2L11O43521 198 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PRSS1P07477 247 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SMIM17P0DL12 118 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 GZMBP10144 247 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PKIAP61925 76 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 RBX1P62877 108 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CCL20P78556 96 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MIAQ16674 131 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 AP1S3Q96PC3 154 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TPPP3Q9BW30 176 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 A0A0D9SG52 128 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV2-8P01709 118 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM97Q5BJF2 176 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 GNG13Q9P2W3 67 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 VAX2Q9UIW0 290 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MGPP08493 103 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 CENPWQ5EE01 88 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 PRR34Q9NV39 138 aa6.66□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 M0QY20 66 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 C11orf52Q96A22 123 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 MANBALQ9NQG1 85 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB19A4D1S5 217 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLC6P0CF74 106 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 IQCJQ1A5X6 159 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 Q6ZNX1 250 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 H7C1H1 209 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 PANO1I0J062 215 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 OXTP01178 125 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 GNG4P50150 75 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 CACNG7P62955 275 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 REG3AQ06141 175 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 IFNA1P01562 189 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 P01737 135 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RAB5CP51148 216 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 RASL11AQ6T310 242 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TMEM243Q9BU79 118 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 hDV102S1A0JD36 115 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP4-206ENST00000446904 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
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