RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMKR1H3BMG3 65 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCR2O95944 276 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 UFSP1Q6NVU6 142 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.68□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHODO00212 210 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 HTN1P15515 57 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 AZU1P20160 251 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 G0S2P27469 103 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 RRN3P1Q2M238 152 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 LGALS9CQ6DKI2 356 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANK2Q01484 3957 aa6.67□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 H7C1H1 209 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 RS1O15537 224 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 GHRHP01286 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 LAGE3Q14657 143 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 SPATA45Q537H7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 C18orf15Q96N68 181 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 ST20Q9HBF5 79 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 AGRNO00468 2067 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 M0QY20 66 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 DLEU1O43261 78 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATP5LO75964 103 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 JPT2Q9H910 190 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.66□□□□□ -1.34
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 VCYO14598 125 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 GAS8-AS1O95177 125 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRM2P04554 102 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGLC3P0DOY3 106 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 KRTAP10-11P60412 298 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00173Q6ZV60 143 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.65□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 A0A087WWL8 130 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 F5H697 171 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 IGHV3-53P01767 116 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 X6R8D5 127 aa6.64□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 EREGO14944 169 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGPP08493 103 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 MIFP14174 115 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF183Q96D59 192 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.63□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 LYRM9A8MSI8 78 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM229AH3BQW9 127 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR4C5Q8NGB2 326 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 MUC4Q99102 2169 aa6.62□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL6A5A8TX70 2615 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF56Q15929 161 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATOH7Q8N100 152 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TOMM6Q96B49 74 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZMAT4Q9H898 229 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.61□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 NUDT3O95989 172 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 Q6ZTI0 123 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 KIR2DL4Q99706 377 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 G3V4G9 280 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 I3L3M4 83 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 OR11H2Q8NH07 326 aa6.6□□□□□ -1.35
CCNDBP1-202ENST00000444658 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS1P07477 247 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 RIPPLY3P57055 190 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 ODF1Q14990 250 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 RHOHQ15669 191 aa6.59□□□□□ -1.36
CCNDBP1-202ENST00000444658 MAJINQ3KP22 176 aa6.59□□□□□ -1.36
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