RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 PKIAP61925 76 aa13.61□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 SCXQ7RTU7 201 aa13.61□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 AP1S3Q96PC3 154 aa13.61□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 DERL1Q9BUN8 251 aa13.61□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 C1orf43Q9BWL3 253 aa13.61□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 MUC21A0A140T8X8 626 aa13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM262E9PQX1 116 aa13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 CCL20P78556 96 aa13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 CRPP02741 224 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 C14orf177Q52M58 125 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 CHAC1Q9BUX1 264 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 GNG13Q9P2W3 67 aa13.59□□□□□ -0.23
UBXN4-204ENST00000426921 F5H697 171 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 IGLV2-8P01709 118 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 IGLC6P0CF74 106 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 RAB5CP51148 216 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 CENPWQ5EE01 88 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 SMIM12Q96EX1 92 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.58□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 ANGP03950 147 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 SMIM17P0DL12 118 aa13.57□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 MIAQ16674 131 aa13.57□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 PRR34Q9NV39 138 aa13.57□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 C19orf71A6NCJ1 209 aa13.56□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 RPS20P60866 119 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa13.55□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 M0QY20 66 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 GZMBP10144 247 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 SSTP61278 116 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 IQCJQ1A5X6 159 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa13.54□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 TEX46H3BTG2 121 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 SULT1A2P50226 295 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 RBX1P62877 108 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 OR2D3Q8NGH3 330 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa13.53□□□□□ -0.24
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L23D6RBM5 183 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 H7C1H1 209 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 PDE6DO43924 150 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 GNG4P50150 75 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 CACNG7P62955 275 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 TPPP3Q9BW30 176 aa13.52□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa13.51□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 SUMO4Q6EEV6 95 aa13.51□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 XKRY2A2RUG3 117 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 RAB19A4D1S5 217 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 F2Z2F3 143 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 J3QL48 77 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 HLA-DQA1P01909 254 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 MGPP08493 103 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 GAGE6Q13070 117 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 P01737 135 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 LINC00269Q8N2A0 174 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 IFNA1P01562 189 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 PRSS1P07477 247 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 BCL2P10415 239 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 BIN3Q9NQY0 253 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 TRGC1P0CF51 173 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 CLPSL2Q6UWE3 100 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 TCTE3Q8IZS6 198 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 CTRLP40313 264 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 RASL11AQ6T310 242 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 C9orf62Q8N4C0 152 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 PGLYRP4Q96LB8 373 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 CNFNQ9BYD5 112 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 DPH3P1Q9H4G8 78 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 MED9Q9NWA0 146 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN4-204ENST00000426921 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 A0A1B0GUV1 79 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 REG3AQ06141 175 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 WDR73Q6P4I2 378 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 C9orf163Q8N9P6 203 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 C20orf203Q8NBC4 194 aa13.45□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 NTF3P20783 257 aa13.44□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP13.44□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 SLC51BQ86UW2 128 aa13.44□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 TMEM243Q9BU79 118 aa13.44□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 NIT2Q9NQR4 276 aa13.44□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 NUDT10Q8NFP7 164 aa13.43□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 NUDT11Q96G61 164 aa13.43□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa13.42□□□□□ -0.26
UBXN4-204ENST00000426921 CLRN3Q8NCR9 226 aa13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75 ms