RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000349984.6

CCR6-202, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 2,980 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-202ENST00000349984 TRAV40A0A0B4J280 105 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 A0A1B0GUT8 65 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 MSMBP08118 114 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 LEPP41159 167 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ATXN8Q156A1 80 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ZNF329Q86UD4 541 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 H3BT86 120 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RIGQ13278 110 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 C1orf158Q8N1D5 194 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 C17orf77Q96MU5 243 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 OTORQ9NRC9 128 aa5.51□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PF4P02776 101 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 MLANAQ16655 118 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PRO1854Q9UHT4 67 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ZNF580Q9UK33 172 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 D6R8Y8 96 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PROP1O75360 226 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 CFC1BP0CG36 223 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 CFC1P0CG37 223 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TMEM30BQ3MIR4 351 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FBN3Q75N90 2809 aa5.5□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 B4DSR2 109 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 C2orf82Q6UX34 121 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FAM216BQ8N7L0 139 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 Q8N8P6 123 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PAXXQ9BUH6 204 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RPL39P5Q59GN2 51 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 BRD3OSQ6XYD6 125 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ORMDL3Q8N138 153 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 CCL13Q99616 98 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ESM1Q9NQ30 184 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 LINC01546A6NGU7 62 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PLNP26678 52 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 Q8IYB0 196 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 S1PR3Q99500 378 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.49□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ARMS2P0C7Q2 107 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 CD177Q8N6Q3 437 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 UPK2O00526 184 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TCRAP04437 139 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 GNG12Q9UBI6 72 aa5.48□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 COX7A2P2O60397 106 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RNF182Q8N6D2 247 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 PEMTQ9UBM1 199 aa5.47□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 LHBP01229 141 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FHL2Q14192 279 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 ZNRF1Q8ND25 227 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 DSCAML1Q8TD84 2053 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 FXYD5Q96DB9 178 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 RNF7Q9UBF6 113 aa5.46□□□□□ -1.53
CCR6-202ENST00000349984 H3BTX0 84 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 H7C423 109 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3-33P01772 117 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 SYNJ2BPP57105 145 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 TMEM14BQ9NUH8 114 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3-48P01763 117 aa5.46□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 ZNF815PA8K554 130 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 ZNF134P52741 427 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 NDUFA3O95167 84 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3-30P01768 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 LOXL3P58215 753 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 PATE2Q6UY27 113 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 Q6ZRU5 148 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 LINC00305Q7Z4B0 112 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 LEAP2Q969E1 77 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 GAFA1Q96PS6 74 aa5.45□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 FMC1Q96HJ9 113 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 FSHBP01225 129 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 CD69Q07108 199 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 ZNF714Q96N38 554 aa5.44□□□□□ -1.54
CCR6-202ENST00000349984 TMEM243Q9BU79 118 aa5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms