RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000308271.13

USP48-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP48, Length 4,595 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP48-201ENST00000308271 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 CNFNQ9BYD5 112 aa14.68□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 RNF152Q8N8N0 203 aa14.67□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 NRACQ8N912 160 aa14.67□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 BLCAPP62952 87 aa14.67□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 A0A0J9YXY3 114 aa14.67□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 CFHR3Q02985 330 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 HHLA3Q9XRX5 114 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 DAND5Q8N907 189 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 SPTBN4Q9H254 2564 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 ZFAND3Q9H8U3 227 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 NACAE9PAV3 2078 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 RS1O15537 224 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 VSIG2Q96IQ7 327 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 ORMDL1Q9P0S3 153 aa14.66□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 NXPH4O95158 308 aa14.65□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 MIAQ16674 131 aa14.65□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 HAMPP81172 84 aa14.65□□□□□ -0.06
USP48-201ENST00000308271 GPHB5Q86YW7 130 aa14.65□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa14.65□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 CEP295Q9C0D2 2601 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 LINC00643Q86TS7 51 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 CRLF1O75462 422 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 P0DMU3 169 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 FAM231AP0DMU4 169 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 FAM231CP0DMU5 169 aa14.64□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 J3QLI3 93 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 EBI3Q14213 229 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV3-33P01772 117 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHG2P01859 326 aa14.63□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.62□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.62□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 ATP5G1P05496 136 aa14.62□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa14.62□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 A0A0J9YX75 114 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 GAS8-AS1O95177 125 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 J3KT08 172 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 TRBV12-3P01733 135 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 A0A1B0GX51 115 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV4-59P01825 116 aa14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 TMEM223A0PJW6 202 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 INSL3P51460 131 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 NFE4Q86UQ8 179 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGF1P05019 195 aa14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 A0A096LNJ9 63 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV3-30P01768 117 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 DEFB112Q30KQ8 113 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 DSCR8Q96T75 97 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 C11orf21Q9P2W6 132 aa14.59□□□□□ -0.07
USP48-201ENST00000308271 ZMAT4Q9H898 229 aa14.58□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 EXPH5Q8NEV8 1989 aa14.58□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 XGP55808 180 aa14.58□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 FASNP49327 2511 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 LINC01548A6NM66 108 aa14.58□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 ODF3Q96PU9 254 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 VPREB3Q9UKI3 123 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 C3orf56Q8N813 242 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 C20orf173Q96LM9 149 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 RNF223E7ERA6 249 aa14.57□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 ABCA2Q9BZC7 2435 aa14.56□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa14.56□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 COX7A2LO14548 114 aa14.56□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TRIAP1O43715 76 aa14.56□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 K7EQD1 137 aa14.55□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 COX7B2Q8TF08 81 aa14.55□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa14.55□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 A0A087WW49 117 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 C5orf38Q86SI9 138 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TMEM89A2RUT3 159 aa14.54□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 COX8CQ7Z4L0 72 aa14.53□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 Q8NA96 180 aa14.53□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa14.53□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.53□□□□□ -0.08
USP48-201ENST00000308271 TRAV4A0A0B4J268 109 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms