RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267176.8

SBNO1-201, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SBNO1, Length 11,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-201ENST00000267176 YPEL4Q96NS1 127 aa4.9□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 NBL1P41271 181 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 RNF138Q8WVD3 245 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TEX22C9J3V5 150 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q6ZUT4 128 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q8N1Y9 231 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DKK4Q9UBT3 224 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 H0YGX0 51 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 BDP1A6H8Y1 2624 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 A0A1B0GXF2 115 aa4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV2-23P01705 113 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 BLCAPP62952 87 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 RNF114Q9Y508 228 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 GDF5OSQ5U4N7 250 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TRAV4A0A0B4J268 109 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 AJUBAQ96IF1 538 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q6ZQT7 251 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q8N9W7 124 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TIMM17AQ99595 171 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 H3BUA1 57 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 COX7B2Q8TF08 81 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q96MF0 132 aa4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4-59P01825 116 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CRYGBP07316 175 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM61Q8N0U2 210 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF462Q96JM2 2506 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MT-ATP8P03928 68 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PSMB8P28062 276 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 K7EQD1 137 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 BPTFQ12830 3046 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 H3BT86 120 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 APOC4P55056 127 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DEFB1P60022 68 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 LECT2O14960 151 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV2-8P01709 118 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 A0A0J9YY99 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGLV1-47P01700 117 aa4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MDFICQ9P1T7 246 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 VPREB3Q9UKI3 123 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 ELANEP08246 267 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 P0C879 139 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PROP1O75360 226 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 SLURP1P55000 103 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 DEFB112Q30KQ8 113 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 RNF152Q8N8N0 203 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 MLST8Q9BVC4 326 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CCL24O00175 119 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 BRWD1-AS2P59051 145 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFC1O43677 76 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 NDUFS5O43920 106 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 LYRM9A8MSI8 78 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PLA2G2CQ5R387 149 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PIFOQ8TCI5 191 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 BRK1Q8WUW1 75 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.86□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 TM2D2Q9BX73 214 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q9HAA7 133 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
SBNO1-201ENST00000267176 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.85□□□□□ -1.63
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