RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 H7C1H1 209 aa7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 FOXI1Q12951 378 aa7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 AMTNQ6UX39 209 aa7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 TOMM6Q96B49 74 aa7.35□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 F8VRH5 84 aa7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 GNRH2O43555 120 aa7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 ID1P41134 155 aa7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 Q6YL49 198 aa7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.34□□□□□ -1.23
PDCL-201ENST00000259467 ORMDL2Q53FV1 153 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 WNK1Q9H4A3 2382 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 K7EQG2 157 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PPP1R17O96001 155 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 C10orf99Q6UWK7 81 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 INSL3P51460 131 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 CRYBA4P53673 196 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.33□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 A0A0J9YX75 114 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ELANEP08246 267 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SPINK8P0C7L1 97 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 Q8N2B8 174 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SYT8Q8NBV8 401 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 C9orf85Q96MD7 179 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ZNF702PQ9H963 129 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 CDIP1Q9H305 208 aa7.32□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 UBE2E2Q96LR5 201 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 COL6A5A8TX70 2615 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 A8MTW9 85 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 J3KRW8 73 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 STAB1Q9NY15 2570 aa7.31□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SPRY2O43597 315 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.3□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 LINC01549A6NIU2 74 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 Q6ZUT4 128 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 CRLF1O75462 422 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 UBE2D1P51668 147 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TEN1Q86WV5 123 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 C11orf44Q8N8P7 122 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 VWFP04275 2813 aa7.29□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PSMB2P49721 201 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 UBE2D3P61077 147 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 UBE2D2P62837 147 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 C2orf66Q6UXQ4 117 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 NFE4Q86UQ8 179 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 BAALCQ8WXS3 180 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ERG28Q9UKR5 140 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 AGRNO00468 2067 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 IGIPA6NJ69 53 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ZNF815PA8K554 130 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TMEM262E9PQX1 116 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 TSPAN13O95857 204 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 PRADC1Q9BSG0 188 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDCL-201ENST00000259467 NOTCH3Q9UM47 2321 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 TRAV2A0A0B4J234 112 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 TSHBP01222 138 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 MT-ATP8P03928 68 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 CRYGDP07320 174 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 ZNF688P0C7X2 276 aa7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 A8MWV9 139 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 MGPP08493 103 aa7.26□□□□□ -1.25
PDCL-201ENST00000259467 XGP55808 180 aa7.26□□□□□ -1.25
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