RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227667.7

APOC3-201, Transcript of apolipoprotein C3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOC3, Length 550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3-201ENST00000227667 NACAE9PAV3 2078 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 IFITM10A6NMD0 228 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 S100A6P06703 90 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 RAB4AP20338 218 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 SRIP30626 198 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 PTH2Q96A98 100 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 XCL2Q9UBD3 114 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.55□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 RNF213Q63HN8 5207 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 ESDP10768 282 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 EVI2AP22794 236 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 LINC00315P59091 139 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 SSTP61278 116 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 DKK2Q9UBU2 259 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.54□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 M0R381 172 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 NUPR1O60356 82 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 PRM2P04554 102 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 LINC01587Q99440 93 aa7.53□□□□□ -1.2
APOC3-201ENST00000227667 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CBY3A6NI87 242 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 AZU1P20160 251 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CCL18P55774 89 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 Q6ZSN1 163 aa7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PRSS47A8MTI9 375 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 D6R8Y8 96 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 GAS8-AS1O95177 125 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 NUDT3O95989 172 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PPBPP02775 128 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 ZNF415Q09FC8 603 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 ORMDL3Q8N138 153 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 AP1S3Q96PC3 154 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 DPH3P1Q9H4G8 78 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.51□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 M0R2P5 195 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SERF1AO75920 110 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CRYGDP07320 174 aa7.5□□□□□ -1.21
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APOC3-201ENST00000227667 TTC32Q5I0X7 151 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 NRACQ8N912 160 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SPXQ9BT56 116 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 Q9H8V8 135 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 JPT2Q9H910 190 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.5□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SMKR1H3BMG3 65 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 NPYP01303 97 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 HTN1P15515 57 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CKS2P33552 79 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 ZNF876PQ49A33 203 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 BAGE3Q86Y29 109 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 RASL10AQ92737 203 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 MRAP2Q96G30 205 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PRELID3AQ96N28 172 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.49□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 LINC01546A6NGU7 62 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 NCR2O95944 276 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 NIT1Q86X76 327 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 TMEM208Q9BTX3 173 aa7.48□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 EREGO14944 169 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 TNFRSF6BO95407 300 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 LINC00614P0C842 121 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 KRTAP10-1P60331 282 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 C16orf74Q96GX8 76 aa7.47□□□□□ -1.21
APOC3-201ENST00000227667 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.46□□□□□ -1.22
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