RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
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SLC25A39-201ENST00000225308 F5H697 171 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 GAGE1Q13065 139 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 GAGE4Q13068 117 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 GAGE5Q13069 117 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 GAGE13Q4V321 117 aa14.94□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa14.94□□□□□ -0.02
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SLC25A39-201ENST00000225308 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A1B0GXF2 115 aa14.92□□□□□ -0.02
SLC25A39-201ENST00000225308 CAMPP49913 170 aa14.92□□□□□ -0.02
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SLC25A39-201ENST00000225308 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.9□□□□□ -0.02
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SLC25A39-201ENST00000225308 M0QY20 66 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 S100A8P05109 93 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC25A39-201ENST00000225308 RASL11AQ6T310 242 aa14.89□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 GTSF1LQ9H1H1 148 aa14.89□□□□□ -0.03
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SLC25A39-201ENST00000225308 FRAS1Q86XX4 4008 aa14.88□□□□□ -0.03
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SLC25A39-201ENST00000225308 UBE2D2P62837 147 aa14.88□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 SIVA1O15304 175 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 WFDC10BQ8IUB3 73 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.87□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 DNAH2Q9P225 4427 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 H7C1H1 209 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.86□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 COLCA2A8K830 154 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 GATD1Q8NB37 220 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 COX19Q49B96 90 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 LELP1Q5T871 98 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM136Q6ZRR5 245 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 AMN1Q8IY45 258 aa14.82□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa14.81□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 DNAH10OSP0CZ25 163 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 TTC32Q5I0X7 151 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 RNF185Q96GF1 192 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa14.8□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 MT-ND6P03923 174 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB5AP20339 215 aa14.79□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 FRZBQ92765 325 aa14.78□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC25A39-201ENST00000225308 GAS8-AS1O95177 125 aa14.77□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa14.77□□□□□ -0.04
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SLC25A39-201ENST00000225308 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 APCSP02743 223 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 RTL8CO15255 209 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 FABP9Q0Z7S8 132 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 C1orf134Q5TEV5 83 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 Q8N3U1 123 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 MRAP2Q96G30 205 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 K7EP13 123 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 FAT2Q9NYQ8 4349 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 CKS2P33552 79 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1644Q3SXP7 199 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 C6orf223Q8N319 242 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 D6R8Y8 96 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 NIT1Q86X76 327 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 SMKR1H3BMG3 65 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 NCR2O95944 276 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 TRGC2P03986 189 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.71□□□□□ -0.05
SLC25A39-201ENST00000225308 SDHAF1A6NFY7 115 aa14.7□□□□□ -0.06
SLC25A39-201ENST00000225308 IGHV3-30P01768 117 aa14.7□□□□□ -0.06
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