RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000224140.5

SETX-201, Transcript of senataxin, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SETX, Length 11,100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETX-201ENST00000224140 XCL2Q9UBD3 114 aa4.84□□□□□ -1.63
SETX-201ENST00000224140 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.84□□□□□ -1.63
SETX-201ENST00000224140 Q71RC1 249 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SETX-201ENST00000224140 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
SETX-201ENST00000224140 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 TIMM17BO60830 172 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CRLF1O75462 422 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 MP68P56378 58 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 A0A087WWL8 130 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 hDV102S1A0JD36 115 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 A4D1N5 150 aa4.84□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 B5MCH6 92 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 MIFP14174 115 aa4.84□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.84□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 TAX1BP3O14907 124 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 GRNP28799 593 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 K7ERS5 55 aa4.83□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 PRSS29PA6NIE9 313 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 NDUFA7O95182 113 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.83□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 K7EP34 96 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CFHR3Q02985 330 aa4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 F8WDY8 70 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CARD19Q96LW7 228 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 ATOX1O00244 68 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 C14orf177Q52M58 125 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 COX17Q14061 63 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 K7EP13 123 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 SELENOKQ9Y6D0 94 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CCL18P55774 89 aa4.82□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 F6UB75 175 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 PTPN13Q12923 2485 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 H3BT86 120 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 ZNF843Q8N446 348 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 C20orf203Q8NBC4 194 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 RITA1Q96K30 269 aa4.81□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 HIVEP2P31629 2446 aa4.81□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 F5H768 121 aa4.81□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 DEFB130AP0DP74 79 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 WFDC11Q8NEX6 87 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 IGHV3-53P01767 116 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 LINC01548A6NM66 108 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 ODF1Q14990 250 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CHCHD7Q9BUK0 85 aa4.81□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 H3BMG7 143 aa4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 Q8N1Y9 231 aa4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 TRANK1O15050 2925 aa4.8□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 C16orf95Q9H693 158 aa4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.8□□□□□ -1.64
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SETX-201ENST00000224140 TP73-AS1Q9UF72 201 aa4.79□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 HTTP42858 3142 aa4.79□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 RETNQ9HD89 108 aa4.79□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 C12orf74Q32Q52 190 aa4.79□□□□□ -1.64
SETX-201ENST00000224140 IGLV2-8P01709 118 aa4.79□□□□□ -1.64
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