RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 VPREB3Q9UKI3 123 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 IGHG2P01859 326 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 Q6ZUT4 128 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 MRAP2Q96G30 205 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 C9JAW5 83 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 USMG5Q96IX5 58 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ID1P41134 155 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SLURP1P55000 103 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CFAP126Q5VTH2 177 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 PLNP26678 52 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 LINC01559Q495D7 138 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 Q6ZSV7 163 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.62□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ELANEP08246 267 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.61□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CRLF1O75462 422 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SMPXQ9UHP9 88 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 A0A087WW49 117 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 PRSS2P07478 247 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CD7P09564 240 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 SPINK13Q1W4C9 94 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 A0A0U1RRA0 63 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 FAM159AQ6UWV7 190 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ZFAND3Q9H8U3 227 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 MUC4Q99102 2169 aa6.6□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 A8MZ25 164 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 NDUFA4O00483 81 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 PRM2P04554 102 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CFC1BP0CG36 223 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 CFC1P0CG37 223 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.59□□□□□ -1.35
RRN3-201ENST00000198767 KNCNA6PVL3 124 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 J3QLI3 93 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 PLA2G2AP14555 144 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 DEFB131AP59861 70 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.59□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 A4D1N5 150 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 A8MWV9 139 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 CRYGDP07320 174 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 CNFNQ9BYD5 112 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TSHBP01222 138 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 MAST4O15021 2626 aa6.58□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 A0A0J9YY99 117 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 ASIPP42127 132 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 DAND5Q8N907 189 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TOMM6Q96B49 74 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 CCDC179H3BU77 68 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 SCGB1A1P11684 91 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TTC32Q5I0X7 151 aa6.57□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 RBAKDNA6NC62 111 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 ORMDL2Q53FV1 153 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TEN1Q86WV5 123 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 A6NJY4 79 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 SLC25A20O43772 301 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TEX29Q8N6K0 151 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 DPH3P1Q9H4G8 78 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TAL2Q16559 108 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 SPXQ9BT56 116 aa6.56□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TRAV21A0A0B4J279 112 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 UBE2D1P51668 147 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 ZNF56Q15929 161 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 A0A0J9YXV3 536 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.55□□□□□ -1.36
RRN3-201ENST00000198767 P0DMU3 169 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms