RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.96□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 A6NJY4 79 aa12.96□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 J3QQQ9 107 aa12.95□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV4-59P01825 116 aa12.92□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.9□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.9□□□□□ -0.34
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa12.89□□□□□ -0.35
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV3-53P01767 116 aa12.83□□□□□ -0.36
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KCNQ1-201ENST00000155840 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 KLLNB2CW77 178 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 CRLF1O75462 422 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 UBE2D3P61077 147 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 UBE2D2P62837 147 aa12.81□□□□□ -0.36
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.81□□□□□ -0.36
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KCNQ1-201ENST00000155840 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
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