RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF32	P17041	273 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-48	P01763	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.58	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	DAND5	Q8N907	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		M0R1W7	72 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		F8WEM9	126 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGKV1-16	P04430	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZS52	159 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		A0A0J9YXV3	536 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		H7BZZ5	65 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6JHZ5	121 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	COX14	Q96I36	57 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TNC	P24821	2201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM27B	Q5VT28	67 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV12-3	P01733	135 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	CXCL6	P80162	114 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ESRG	Q1W209	222 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	NRAC	Q8N912	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ADAMTS20	P59510	1910 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	PRM2	P04554	102 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	LYZ	P61626	148 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		Q6ZSV7	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		I3L3M4	83 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	BSPH1	Q075Z2	132 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	NDP	Q00604	133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFC1	O43677	76 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	PATE2	Q6UY27	113 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		K7EQD1	137 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	COX6B1	P14854	86 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072		Q8IYB0	196 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	C10orf128	Q5T292	105 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NECAP1-222	ENST00000640072	PSPHP1	O15172	72 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	FSTL3	O95633	263 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNHIT1	O43257	154 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	PRCD	Q00LT1	54 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	KLLN	B2CW77	178 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	FOLR3	P41439	243 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	RMI2	Q96E14	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	SOCS3	O14543	225 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	RNF185	Q96GF1	192 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	SORL1	Q92673	2214 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		4.51	□□□□□ -1.69
NECAP1-222	ENST00000640072	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		4.51	□□□□□ -1.69

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