RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639159.1

LINC01138-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1138, human

TSL 5 BASIC

Gene LINC01138, Length 1,521 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01138-208	ENST00000639159	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM223A	Q8IWN6	122 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	DAND5	Q8N907	189 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CHCHD5	Q9BSY4	110 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	PEMT	Q9UBM1	199 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CDH23	Q9H251	3354 aa		5	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159		E7EQL1	145 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	NPFF	O15130	113 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CRYGA	P11844	174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159		Q8N9W7	124 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	LITAF	Q99732	161 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159		I3L3M4	83 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	SOCS3	O14543	225 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAC	P01848	142 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	ELANE	P08246	267 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	COX7C	P15954	63 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	UBE2E1	P51965	193 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	KLLN	B2CW77	178 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159		F5H697	171 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	NDUFA4	O00483	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	HERVK_113	P63121	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	COX7A2L	O14548	114 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	TMEM258	P61165	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	ECSCR	Q19T08	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	C20orf173	Q96LM9	149 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	DUX3	Q96PT4	197 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		H3BUA1	57 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		M0QY20	66 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PRSS2	P07478	247 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PF4V1	P10720	104 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	ID1	P41134	155 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	LPAL2	Q16609	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		A0A0J9YXV3	536 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	GNRH2	O43555	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	CD28	P10747	220 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	NDUFA1	O15239	70 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PRORY	Q9H606	182 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PF4	P02776	101 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGF1	P05019	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159		A0A087WWL8	130 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LINC01138-208	ENST00000639159	TIRAP	P58753	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms