RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 SPAG11BQ08648 103 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 NCOR1O75376 2440 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G5P39877 138 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 SPATA25Q9BR10 227 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.71□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 MP68P56378 58 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DAND5Q8N907 189 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 SEC61GP60059 68 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 A4D1N5 150 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CFC1BP0CG36 223 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CFC1P0CG37 223 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C11orf52Q96A22 123 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 I3L2K1 104 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 INSL3P51460 131 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 WFDC2Q14508 124 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 ATOX1O00244 68 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNA3P51805 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C14orf177Q52M58 125 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 HELZP42694 1942 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 HILS1P60008 231 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DYSFO75923 2080 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EN84 100 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CTSGP08311 255 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM110AQ9BQ89 295 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB1P60022 68 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C12orf74Q32Q52 190 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFA11Q86Y39 141 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 FRMPD3Q5JV73 1810 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EIM0 57 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 ROS1P08922 2347 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PTH2Q96A98 100 aa6.69□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0J9YXV3 536 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A096LNI7 61 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGF2-ASQ6U949 168 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 MYLKQ15746 1914 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 NCKAP5O14513 1909 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DIRC1Q969H9 104 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EMI3 77 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.68□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TSC2P49815 1807 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A087WZ39 114 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV4-1P06312 121 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 RPL39P62891 51 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PRO3102Q9H379 93 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PRAC2D3DTV9 90 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV1-17P01599 117 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TRBV12-3P01733 135 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CRYGDP07320 174 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PRO0255Q9UI72 69 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.67□□□□□ -1.341e-6■■■□□ 17.9
CYFIP1-208ENST00000617928 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.67□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N7P7 452 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 C20orf173Q96LM9 149 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TTC28Q96AY4 2481 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 H0YGX0 51 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 RBX1P62877 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 K7EMT4 169 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 M0R2N4 97 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PRORYQ9H606 182 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.66□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 FOXI1Q12951 378 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 HEATR5AQ86XA9 2040 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 PCP2Q8IVA1 136 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CXCL5P42830 114 aa6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CYFIP1-208ENST00000617928 CASC2Q6XLA1 102 aa6.65□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.65□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 TDRG1Q3Y452 100 aa6.65□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 C19orf84I3L1E1 186 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 UBE2D1P51668 147 aa6.64□□□□□ -1.35
CYFIP1-208ENST00000617928 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1065 ms