RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613424.4

IRF1-211, Transcript of interferon regulatory factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IRF1, Length 821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1-211ENST00000613424 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 ESRGQ1W209 222 aa11.51□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 SOHLH1Q5JUK2 328 aa11.51□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 NAT8Q9UHE5 227 aa11.51□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 LINC00588Q9Y4M8 146 aa11.51□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 A0A1W2PPQ1 181 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 F2Z2F3 143 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 RPL23P62829 140 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 FAM74A4Q5TZK3 123 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.5□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 RHODO00212 210 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 ISOC2Q96AB3 205 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 PRADC1Q9BSG0 188 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 OSTCQ9NRP0 149 aa11.49□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 SRIP30626 198 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 CACNG7P62955 275 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 RHOHQ15669 191 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 ADIRFQ15847 76 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 NEGR1Q7Z3B1 354 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 GTSF1Q8WW33 167 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 MSRB1Q9NZV6 116 aa11.48□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 A8MWL6 223 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 CT83Q5H943 113 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 WDR73Q6P4I2 378 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 LYPD5Q6UWN5 251 aa11.47□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 NTF3P20783 257 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 CTRLP40313 264 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 Q9UF83 564 aa11.46□□□□□ -0.57
IRF1-211ENST00000613424 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 ZNRF2Q8NHG8 242 aa11.45□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa11.45□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 V9GYV3 84 aa11.45□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 SMIM17P0DL12 118 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 RAB4BP61018 213 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 SH2D6Q7Z4S9 175 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 OR10G8Q8NGN5 311 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 TSKUQ8WUA8 353 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 PGLYRP4Q96LB8 373 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 AP1S3Q96PC3 154 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 CNFNQ9BYD5 112 aa11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GAGE12JA6NER3 117 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 LINC00315P59091 139 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GAGE1Q13065 139 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GAGE4Q13068 117 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GAGE5Q13069 117 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 TWIST1Q15672 202 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GAGE13Q4V321 117 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 UPK3BQ9BT76 320 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 Q9H8V8 135 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 DNAH2Q9P225 4427 aa11.43□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 F5H697 171 aa11.42□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 M0R2N4 97 aa11.42□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 EVI2AP22794 236 aa11.42□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 ZNF56Q15929 161 aa11.42□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 UQCC3Q6UW78 93 aa11.42□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 DNAH10Q8IVF4 4471 aa11.41□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 FAM231BA6NCW3 169 aa11.41□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 HIGD1CA8MV81 97 aa11.41□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 TRGC1P0CF51 173 aa11.41□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa11.41□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa11.4□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 LINC00694P0DN24 101 aa11.4□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 COMMD7Q86VX2 200 aa11.4□□□□□ -0.58
IRF1-211ENST00000613424 LINC00862A6NCI5 91 aa11.39□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 MGPP08493 103 aa11.39□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 TIRAPP58753 221 aa11.39□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 Q6ZR54 194 aa11.39□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.39□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 TMEM218A2RU14 115 aa11.38□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 NUP35Q8NFH5 326 aa11.38□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 BORCS7Q96B45 105 aa11.38□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 GTSF1LQ9H1H1 148 aa11.38□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 A0A1B0GUT8 65 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 SIVA1O15304 175 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 NAT8BQ9UHF3 227 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.37□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 M0QY20 66 aa11.36□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 ADCYAP1P18509 176 aa11.36□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 SUMO4Q6EEV6 95 aa11.36□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 SMIM15Q7Z3B0 74 aa11.36□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 F8W036 122 aa11.35□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 UBE2D3P61077 147 aa11.35□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 UBE2D2P62837 147 aa11.35□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 WFDC10BQ8IUB3 73 aa11.35□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 PPP1R2P9O14990 202 aa11.34□□□□□ -0.59
IRF1-211ENST00000613424 LELP1Q5T871 98 aa11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.9 ms