RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601471.1

LINC00649-212, long intergenic non-protein coding RNA 649, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00649, Length 538 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00649-212ENST00000601471 JPT2Q9H910 190 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 HSPG2P98160 4391 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 RAB19A4D1S5 217 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 K7EP13 123 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 SIVA1O15304 175 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 CRYGDP07320 174 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 IGLC6P0CF74 106 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 PRR27Q6MZM9 219 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 MED9Q9NWA0 146 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00649-212ENST00000601471 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 M0R381 172 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 K7EN84 100 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 Q9UF83 564 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 A0A087WWL8 130 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 LINC00315P59091 139 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TNP2Q05952 138 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TEX261Q6UWH6 196 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 FAM210AQ96ND0 272 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 BIN3Q9NQY0 253 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 LY96Q9Y6Y9 160 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 P01737 135 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 CTRLP40313 264 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TOR2AQ5JU69 321 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 LELP1Q5T871 98 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 OCC1Q8TAD7 63 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 CNFNQ9BYD5 112 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GZMBP10144 247 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 RAB4BP61018 213 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 NUDT11Q96G61 164 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 AP1S3Q96PC3 154 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 XKRY2A2RUG3 117 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE12JA6NER3 117 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 F2Z2F3 143 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 EVI2AP22794 236 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 UBE2D3P61077 147 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 UBE2D2P62837 147 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE1Q13065 139 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE4Q13068 117 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE5Q13069 117 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 GAGE13Q4V321 117 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 WDR73Q6P4I2 378 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00649-212ENST00000601471 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 A0A087WWC5 75 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 CACNG7P62955 275 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 CT83Q5H943 113 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 LINC01551Q86U37 167 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 GTSF1Q8WW33 167 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 LAGE3Q14657 143 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF56Q15929 161 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 NFE4Q86UQ8 179 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 SMIM7Q9BQ49 75 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 C9JQL5 133 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 M0QY20 66 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 TPPP3Q9BW30 176 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00649-212ENST00000601471 ZNF727A8MUV8 499 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms