RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596332.1

LIG1-210, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIG1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-210ENST00000596332 ADIRFQ15847 76 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 WDR73Q6P4I2 378 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 ATRAIDQ6UW56 229 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 OR4C5Q8NGB2 326 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 RYR2Q92736 4967 aa7.34□□□□□ -1.23
LIG1-210ENST00000596332 A0A096LPF7 62 aa7.33□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.33□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 A0A0J9YY99 117 aa7.33□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.33□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.33□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 TSKUQ8WUA8 353 aa7.33□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.33□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 FAM231BA6NCW3 169 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 A8MWL6 223 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 A8MWV9 139 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 F2Z2F3 143 aa7.32□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 ZFP82Q8N141 532 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 GFRA4Q9GZZ7 299 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 PRO0255Q9UI72 69 aa7.32□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.31□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.31□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.31□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 XKRY2A2RUG3 117 aa7.3□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 K7EQD1 137 aa7.3□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 P0DMU3 169 aa7.3□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 FAM231CP0DMU5 169 aa7.3□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.29□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 A6NJY4 79 aa7.28□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.28□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 GAS8-AS1O95177 125 aa7.28□□□□□ -1.24
LIG1-210ENST00000596332 NUDT3O95989 172 aa7.28□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 RHEBQ15382 184 aa7.28□□□□□ -1.24
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LIG1-210ENST00000596332 A0A1B0GXF2 115 aa7.27□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 M0QY20 66 aa7.27□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 RHODO00212 210 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIG1-210ENST00000596332 TWIST1Q15672 202 aa7.27□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.27□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.27□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 RNF185Q96GF1 192 aa7.27□□□□□ -1.25
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LIG1-210ENST00000596332 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 COLCA2A8K830 154 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 PPP1R2P9O14990 202 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 S100A6P06703 90 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 RHOHQ15669 191 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 AP1S3Q96PC3 154 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.25□□□□□ -1.25
LIG1-210ENST00000596332 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.25□□□□□ -1.25
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