RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 OR2G3Q8NGZ4 309 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 IL36BQ9NZH7 164 aa8.46□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 H3BVH4 76 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 HLA-DQA1P01909 254 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 STAG3L2P0CL84 134 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 STAG3L3P0CL85 134 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CYCSP99999 105 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 KCNIP4Q6PIL6 250 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 SUN5Q8TC36 379 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 EPDR1Q9UM22 224 aa8.45□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 MUC2Q02817 5179 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 A0A087WWL8 130 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 GAS8-AS1O95177 125 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 MPC2O95563 127 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CRPP02741 224 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 UBE2D3P61077 147 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 UBE2D2P62837 147 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 ODF1Q14990 250 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 MPV17L2Q567V2 206 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 C15orf54Q8N8G6 183 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 TMEM262E9PQX1 116 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 GCHFRP30047 84 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 SDIM1Q6ZPB5 146 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 OR11H4Q8NGC9 324 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 B4DEV8 164 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 DNLZQ5SXM8 178 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 RAB24Q969Q5 203 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 SFRP2Q96HF1 295 aa8.42□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 A0A0D9SG52 128 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 GRIFINA4D1Z8 144 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 PET100P0DJ07 73 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.41□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 M0R036 132 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 M0R381 172 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CRIP1P50238 77 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 RPL19P84098 196 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 MIAQ16674 131 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 OR10G8Q8NGN5 311 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 LINC01600Q96MT4 127 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-211ENST00000592658 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 Q86TA4 180 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 MED28Q9H204 178 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 TMEM167BQ9NRX6 74 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.39□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 SH2D1AO60880 128 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PRR34Q9NV39 138 aa8.38□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 CXorf1O96002 111 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 CHTF8P0CG12 524 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 TPT1P13693 172 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 RGS21Q2M5E4 152 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 Q5BKY6 102 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 ZFP82Q8N141 532 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 CHCHD5Q9BSY4 110 aa8.37□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 A0A087WYN8 130 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 A0A1W2PRE2 83 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PEX7O00628 323 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 ATP6V0CP27449 155 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 RBX1P62877 108 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 LINC01559Q495D7 138 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PRR27Q6MZM9 219 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 COX8CQ7Z4L0 72 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 CLRN3Q8NCR9 226 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PHOX2AO14813 284 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 IFNA7P01567 189 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 SLPIP03973 132 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 GIPP09681 153 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 KRTAP10-8P60410 259 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 UBE2G2P60604 165 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 RAB4BP61018 213 aa8.34□□□□□ -1.07
CTIF-211ENST00000592658 PKIAP61925 76 aa8.34□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms